针对您提出的“商调函上寄至的有效期过了档案还没到是否违法”的问题，首先我们需要明确的是，商调函的有效期与档案的到达时间并不直接构成法律上的违法判定标准。不过，我们可以从档案管理的相关法律法规出发，来详细分析这个问题。

一、商调函有效期的法律意义

商调函的有效期通常是发函单位为了确保档案调转的及时性和有效性而设定的一个时间范围。这个有效期主要是用于内部管理，确保档案调转流程的顺畅进行，但它本身并不直接产生法律上的约束力，即过了有效期并不意味着就违反了法律。

二、档案未按时到达的可能原因

档案未能在商调函规定的有效期内到达，可能由多种原因造成，如：

1. 邮寄延误：由于邮寄过程中的不可抗力因素（如天气、交通等）导致档案未能按时送达。
2. 处理流程延迟：接收单位可能因内部处理流程繁琐或人员不足等原因，导致档案处理延迟。
3. 信息沟通不畅：发函单位与接收单位之间可能存在信息沟通不畅的情况，导致档案调转流程受阻。

三、法律层面的分析

从《中华人民共和国档案法》及其相关实施办法来看，并未直接规定商调函有效期过了而档案未到是否构成违法。法律主要关注的是档案的保管、利用、移交等环节是否符合规定，以及是否存在丢失、擅自提供、抄录、复制、公布、买卖、非法转让、篡改、损毁、伪造或擅自销毁档案等违法行为。

四、建议措施

1. 及时沟通：发函单位应与接收单位及时沟通，了解档案未到的原因，并协商解决方案。
2. 延长有效期或重新发函：如因特殊原因需要延长商调函的有效期，发函单位可与接收单位协商并延长有效期；或根据实际情况重新发函。
3. 关注档案安全：在等待档案到达的过程中，发函单位应关注档案的安全，确保档案不被丢失、损毁或泄露。

综上所述，商调函上寄至的有效期过了而档案未到，并不直接构成违法。但发函单位应与接收单位及时沟通，了解原因并采取相应措施，以确保档案调转流程的顺利进行。