结论：离职1个月后门店库存少了5000元，一般情况下，公司无权直接扣你的工资。但具体是否可以扣工资，还需根据实际情况和证据来判断。
分析：
劳动关系已解除：
- 既然你已经离职1个月，那么你与公司的劳动关系已经解除。在劳动关系解除后，公司通常不能直接扣除你的工资，除非有明确的法律规定或合同约定。
库存短缺的责任归属：
- 库存短缺的责任需要明确归属。如果库存短缺是由于你的工作失误或故意行为导致的，并且公司有充分的证据证明这一点，那么公司可能会通过法律途径追究你的责任，但这并不意味着公司可以直接扣除你的工资。
- 如果库存短缺与你的工作无关，或者公司无法证明是你的责任，那么公司无权要求你承担损失。
公司扣工资的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和相关规定，公司扣除员工工资必须基于合法、合理的理由，并且需要遵循一定的程序。例如，公司需要证明员工的过错行为与损失之间存在直接因果关系，并且需要提前告知员工扣除工资的决定和理由。
- 在没有明确证据和合法程序的情况下，公司直接扣除你的工资是违法的。
可能的法律后果：
- 如果公司未经合法程序直接扣除你的工资，你可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司支付被扣除的工资，并可能要求公司支付赔偿金。
建议：
- 与公司沟通：首先，你可以尝试与公司沟通，了解库存短缺的具体情况和公司的处理意见。如果公司能够提供充分的证据证明是你的责任，并且你愿意承担部分或全部损失，可以与公司协商解决方案。
- 保留证据：无论结果如何，你都应该保留好与库存短缺相关的所有证据，如工作记录、交接清单等，以备不时之需。
- 寻求法律帮助：如果公司坚持扣除你的工资，并且你认为这是不合法的，你可以咨询专业律师（即我，孙华隆律师，专注于婚姻家庭、合同纠纷、劳动仲裁、民间借贷领域）或向劳动监察部门投诉，以维护自己的合法权益。
总结：离职后门店库存短缺，公司无权直接扣除你的工资。如果公司认为你有责任，需要提供充分的证据，并遵循合法程序。如有争议，建议及时沟通并寻求法律帮助。