自动离职和除名在劳动关系处理中是两个不同的概念，它们有着明显的区别。
首先，我们来看自动离职：
自动离职通常指的是职工在终止劳动关系时，没有按照规定的程序履行解除手续，而是擅自出走离岗，或者解除手续尚未办理完毕就离开了单位。在《劳动合同法》实施之前，自动离职可能被视为员工单方违法解除劳动合同的行为。但自《劳动合同法》实施后，虽然“自动离职”这一具体表述在法律条文中不再明确提及，但类似“不辞而别”等情形仍会被视为员工未按照正常程序离职。对于这种情况，用人单位不能直接认定双方劳动关系已经解除，而应当通过要求员工办理辞职手续、送达催告复工通知书等方式进行处理。如果联系不上员工，用人单位应当及时按照严重违反规章制度等理由与员工解除劳动关系，以避免劳动关系一直存续。
接下来，我们再看除名：
除名则是由用人单位提出，与无正当理由旷工的职工终止劳动关系的一种行政处理方式。它不属于行政处分，而是指职工无正当理由旷工超过一定期间（通常是连续旷工时间超过15天，或者1年以内累计旷工时间超过30天），单位依法从职工名册中除掉其姓名。除名的条件包括：职工经常旷工没有正当理由、经批评教育无效、达到规定的旷工天数。与自动离职不同，除名是用人单位根据职工的旷工行为，依法作出的终止劳动关系的决定。
总结来说：
在实际操作中，用人单位应当明确区分这两种情况，并根据具体情况采取相应的处理措施。对于自动离职的职工，用人单位应当通过合法途径与其解除劳动关系；对于除名的职工，用人单位则应当确保除名决定符合法律法规的规定，并妥善处理相关后续事宜。