病假长休工资的折扣比例并非由单一主体决定，而是依据法律法规、公司规章制度以及劳动合同的约定综合确定。以下从不同角度详细分析：

一、法律法规层面

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及《劳动部关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》等相关规定，职工在医疗期内，企业应当按照规定支付其病假工资或疾病救济费。具体来说：

1. 病假工资的最低标准：病假工资可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。这是法律法规对病假工资的最低保障。

2. 医疗期内的工资支付：在医疗期内，企业应当根据职工的实际工作年限和在本单位的工作年限，给予一定期限的医疗期，并在医疗期内按照上述规定支付病假工资。

二、公司规章制度层面

除了法律法规的最低要求外，公司还可以根据自身的实际情况，制定更为详细的病假工资支付制度。这些制度通常会在公司的员工手册或劳动合同中明确规定，包括但不限于：

1. 病假工资的折扣比例：公司可以根据职工的病假时长、职位等级、工作表现等因素，设定不同的病假工资折扣比例。例如，短期病假可能不折扣或折扣较少，而长期病假则可能享受较低的折扣比例。

2. 病假工资的支付方式：公司还可以规定病假工资的支付方式，如按月支付、按季度支付或一次性支付等。

三、劳动合同层面

劳动合同是职工与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。在劳动合同中，双方可以就病假工资的支付问题进行具体约定。这种约定通常具有更高的法律效力，只要不违反法律法规的强制性规定，就应当得到遵守。

1. 约定优先原则：如果劳动合同中明确约定了病假工资的折扣比例或支付方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么应当优先适用劳动合同中的约定。

2. 约定变更与解除：在劳动合同履行过程中，如果双方需要变更或解除关于病假工资的约定，应当协商一致并签订书面协议。

法律建议

1. 了解法律法规：职工在享受病假待遇时，应当首先了解相关的法律法规，确保自己的权益得到保障。

2. 查阅公司制度：除了法律法规外，职工还应当查阅公司的规章制度和劳动合同，了解公司对于病假工资的具体规定。

3. 及时沟通协商：如果职工对于病假工资的折扣比例或支付方式有疑问或不满，应当及时与用人单位进行沟通协商，寻求合理的解决方案。

4. 寻求法律援助：如果协商无果或用人单位存在违法行为，职工可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。