结论：自动离职的情况下，公司仍然有义务为员工开具离职证明。以下是详细解释和建议：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条的规定：“用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。”这一条款明确规定了用人单位在劳动关系解除或终止时的义务，包括开具离职证明，且这一义务并不因员工是主动辞职、被解雇还是自动离职而有所区别。

二、自动离职的特殊性

自动离职通常指的是员工在未与公司正式解除劳动合同的情况下，擅自离开工作岗位的行为。尽管这种行为可能违反了公司的规章制度或劳动合同中的约定，但它并不免除公司开具离职证明的义务。因为离职证明是员工与原公司劳动关系结束的法定证明，对于员工后续的新工作入职、社保转移等事项至关重要。

三、实际操作建议

1. 主动沟通：

   • 首先，建议员工尝试与公司的HR部门或相关负责人进行沟通，说明需要离职证明的原因，并请求公司配合开具。在沟通过程中，保持冷静和理性，避免情绪化的表达。

2. 书面申请：

   • 如果口头沟通无果，员工可以提交一份正式的书面申请，明确表达需求，并附上必要的个人信息和离职日期等。书面申请应尽可能详细和具体，以便公司能够准确理解员工的需求。

3. 寻求法律途径：

   • 如果公司仍然拒绝开具离职证明，员工可以考虑向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在投诉或仲裁过程中，员工需要提供相关证据，如劳动合同、工资流水、考勤记录等，以证明自己与公司的劳动关系以及公司的拒绝行为。
   • 向劳动监察部门投诉：适用于希望快速解决问题且证据充分的情形。员工可以携带相关材料前往当地人力资源和社会保障局的劳动监察大队，填写投诉表格并提交证据，等待立案处理。
   • 申请劳动仲裁：适用于需确认劳动关系或主张经济补偿的情形。员工需要准备仲裁申请书、身份证明、证据清单等材料，向劳动争议仲裁委员会提交并预缴仲裁费。仲裁委员会将在45日内作出裁决。

4. 替代解决方案：

   • 在维权期间，如果员工需要紧急使用离职证明，可以考虑提供其他证明材料作为替代，如银行工资流水、社保缴纳记录、工作证等。部分机构可能接受此类材料作为离职证明的替代。

四、可能面临的法律后果

如果公司拒绝开具离职证明，除了可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁委员会的裁决外，还可能对员工的后续就业和社保转移等造成不利影响。因此，建议公司在员工离职时，无论员工是主动辞职还是自动离职，都应按照法律规定开具离职证明。

最后，如果你在自动离职后遇到公司拒绝开具离职证明的情况，不要慌张和气馁。你可以按照上述建议逐步操作，维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。