违章建筑买卖合同一般应认定为无效，但存在例外情况。以下是对此问题的详细分析：
一、违章建筑的定义与性质
违章建筑，通常指的是未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的建筑物或构筑物。这类建筑因违反《中华人民共和国城乡规划法》等法律法规的强制性规定，在法律上不被认可，且可能面临被拆除的风险。
二、合同效力的法律依据
《中华人民共和国民法典》：
- 根据第一百五十三条第一款，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。违章建筑的建设违反了《城乡规划法》等相关法律法规，因此基于违章建筑签订的买卖合同因违反法律强制性规定而无效。
- 同时，根据第五百九十七条，因出卖人未取得处分权致使标的物所有权不能转移的，买受人可以解除合同并请求出卖人承担违约责任。违章建筑无法办理合法的产权转移手续，属于标的物所有权不能转移的情形，进一步说明其买卖合同存在效力瑕疵。
《中华人民共和国城乡规划法》：
- 该法明确规定了建设工程的规划许可制度，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，将面临责令停止建设、罚款、限期拆除等行政处罚。这些规定强化了违章建筑的违法性质，基于此的买卖合同也会因违反上位法的强制性规定而被认定为无效。
《城市房地产管理法》：
- 该法规定，未依法登记领取权属证书的房地产不得转让。违章建筑因未取得合法产权证明，无法办理过户手续，买方无法获得该建筑物的合法所有权，因此违章建筑的买卖合同无效。
三、司法实践中的特殊情况
在司法实践中，如果在一审法庭辩论终结前违章建筑人依法补办了相关审批手续，使违章建筑转化为合法建筑，此时违章建筑的买卖合同可被认定为有效。这是因为补办手续后，建筑物的违法性得以消除，合同内容不再违反法律强制性规定，从而具备了法律效力。
四、法律后果与建议
法律后果：
- 若违章建筑的买卖合同被认定为无效，根据《民法典》的相关规定，双方需承担相应的法律后果。具体来说，买方应返还房屋，卖方则需退还已收取的购房款。同时，若一方因过错导致对方损失，应承担赔偿责任。例如，卖方明知房屋为违章建筑仍出售，造成买方装修等损失的，需承担相应责任；而买方若未尽审查义务也存在过错，则需自行承担部分损失。
建议：
- 鉴于违章建筑的买卖合同一般应认定为无效，且可能引发不必要的法律纠纷和经济损失，建议在实际操作中避免购买或出售违章建筑。
- 对于已经涉及违章建筑买卖合同的情况，若希望合同有效，应尽快补办相关审批手续，使违章建筑转化为合法建筑。
- 若因违章建筑买卖合同产生纠纷，应及时向我咨询，通过法律途径维护自身权益。
综上所述，违章建筑的买卖合同因违反法律强制性规定而一般应认定为无效，但存在补办手续使合同有效的例外情况。在实际操作中，应谨慎对待违章建筑的买卖问题，以避免不必要的法律风险。