结论：是否需要赔违约金，主要取决于您与乡镇卫生院签订的聘用合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同约定角度
查看合同条款：
- 首先，您需要仔细查阅与乡镇卫生院签订的聘用合同，特别是关于违约责任、服务期以及离职条件等条款。
- 如果合同中明确规定了在服务期内离职需要支付违约金，并且您的情况符合该条款的触发条件，那么您可能需要按照合同约定支付违约金。
合同解释与争议：
- 如果合同中的相关条款存在模糊或不明确之处，或者双方对条款的解释存在争议，那么可能需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决。
- 在这种情况下，建议您咨询专业律师，以便更准确地理解合同条款的含义和法律效力。
二、法律法规角度
《劳动合同法》的相关规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
- 如果劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
特殊情况下的免责：
- 如果您考取研究生属于不可抗力因素（如因政策变化、家庭突发状况等导致无法继续履行合同），且您能够提供充分证据证明这一点，那么您可能不需要支付违约金。
- 另外，如果乡镇卫生院存在违法行为（如未按时支付工资、未提供劳动保护等），您有权解除合同且不需要支付违约金。
三、实际操作建议
与用人单位协商：
- 在决定离职前，建议您先与乡镇卫生院进行协商，说明您的情况和离职意愿，并尝试就违约金问题达成一致意见。
- 通过协商，双方可以更加理性地处理问题，避免不必要的法律纠纷。
咨询专业律师：
- 如果协商无果或您对合同条款、法律法规存在疑问，建议您咨询专业律师。
- 律师可以根据您的具体情况和合同条款，为您提供更准确的法律意见和解决方案。
准备相关证据：
- 在处理此类纠纷时，相关证据（如合同、培训记录、工资单等）的收集和整理至关重要。
- 建议您提前准备好这些证据，以便在需要时能够迅速提供。
最后，是否需要赔违约金取决于多种因素，包括合同条款、法律法规以及实际情况等。因此，在做出决定前，请您务必仔细考虑并咨询专业律师的意见。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。