老板故意克扣工资1000元是违法的。以下从几个方面为你详细分析：

法律背景

根据《中华人民共和国劳动法》以及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。老板故意克扣工资，无论金额大小，都违反了这一法律规定，侵害了劳动者的合法权益。

法律后果

1. 补发工资及赔偿：

   • 老板克扣工资后，劳动者有权要求老板补发被克扣的工资。
   • 如果因克扣工资给劳动者造成损失的，老板还应当承担赔偿责任。

2. 行政处罚：

   • 劳动行政部门有权对用人单位进行监督检查，对于克扣工资等违法行为，劳动行政部门可以责令用人单位支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。
   • 如果用人单位拒不支付，劳动行政部门还可以给予罚款等行政处罚。

3. 劳动争议解决：

   • 劳动者可以与用人单位协商解决克扣工资的问题。
   • 如果协商不成，劳动者可以向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
   • 对仲裁裁决不服的，劳动者还可以向人民法院提起诉讼。

具体建议

1. 收集证据：

   • 劳动者应当保留好与工资相关的证据，如工资条、银行转账记录、劳动合同等，以便在需要时证明自己的工资被克扣。

2. 与老板沟通：

   • 在采取法律行动之前，劳动者可以先尝试与老板进行沟通，了解克扣工资的原因，并尝试协商解决。

3. 寻求法律援助：

   • 如果沟通无果，或者老板拒绝补发工资，劳动者可以寻求法律援助，向劳动行政部门投诉，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

举例说明

假设你是一名员工，与用人单位签订了劳动合同，约定每月工资为5000元。然而，在某个月份，老板只支付了你4000元，克扣了1000元。在这种情况下，你有权要求老板补发这1000元工资，并可以依据相关法律规定，要求老板承担因克扣工资给你造成的损失（如果有的话）。如果老板拒绝补发，你可以向劳动行政部门投诉，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

综上所述，老板故意克扣工资1000元是违法的，劳动者有权要求补发工资并寻求法律援助。如果你遇到类似情况，可以直接向我咨询，我会为你提供更具体的法律建议和帮助。