结论前置：即使离职时签署了“工资已结清”的协议，但实际上工资并未完全结清，你仍然有权通过合法途径追讨剩余工资，包括申请劳动仲裁。
一、法律依据与权利基础
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”以及《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”这些法律规定明确了用人单位支付工资的义务，即使签署了工资结清的证明，若实际未结清，用人单位仍负有支付剩余工资的义务。
二、追讨剩余工资的具体步骤
收集证据材料：
- 劳动合同与工资条：提供劳动合同中关于工资支付的条款，以及过往的工资条或银行流水记录，以证明应得工资金额。
- 沟通记录：保留与用人单位关于工资问题的沟通记录，如邮件、短信、录音等，作为协商或仲裁的依据。
- 签署文件副本：保存当时签署的“工资已结清”协议的副本，以便在需要时说明签署背景及争议点。
尝试协商解决：
- 首先，建议与用人单位进行友好协商，明确指出工资未结清的事实，并要求其履行支付义务。通过沟通可能快速解决问题，避免法律纠纷。
申请劳动仲裁：
- 若协商无果，可向当地劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请。需提交书面仲裁申请书，并附上相关证据材料。仲裁委员会将依法审理案件，作出裁决。
提起诉讼（如必要）：
- 对仲裁结果不满意时，可在法定期限内向人民法院提起诉讼。法院将根据双方提供的证据和法律规定作出判决。需注意诉讼程序复杂且耗时较长，但这是维护自身权益的最终法律手段。
三、注意事项
时效限制：
- 劳动仲裁的申请期限通常为一年，从知道或应当知道权利被侵害之日起计算。因此，务必在法定期限内提起仲裁申请，逾期可能影响维权效果。
合法途径：
- 在追讨工资的过程中，务必遵循法律法规，避免采取过激行为影响自身权益。例如，不要采取非法手段如破坏公司财物、威胁或恐吓等。
法律援助：
- 如果经济困难，可以向当地法律援助机构申请免费法律服务。法律援助机构会为你提供专业的法律帮助，包括代理仲裁或诉讼等。
四、可能面临的法律后果
- 如果用人单位确实存在拖欠工资的行为，根据《劳动保障监察条例》第二十六条，用人单位可能面临劳动保障行政部门的责令限期支付、加付赔偿金等处罚。
- 对于你而言，如果成功追讨到剩余工资，将维护自身的合法权益；如果未能成功，也可以通过法律途径继续维权，但可能需要承担一定的诉讼成本和时间成本。
最后建议：在处理此类纠纷时，务必保持冷静和理性，通过合法途径维护自身权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。