结论前置：员工若配合公司从农民工工资专户取钱再返回给公司，可能涉及违法甚至犯罪行为，需承担相应的法律责任，具体包括民事责任、行政责任乃至刑事责任。

详细分析：

1. 民事责任：

   • 违反合同义务：员工与公司之间存在劳动合同关系，员工有义务遵守公司的规章制度和法律法规。若员工配合公司进行此类操作，可能违反了劳动合同中的忠诚义务或诚实信用原则，公司有权依据合同约定或法律规定追究员工的违约责任。
   • 损害公司利益：如果此类行为导致公司遭受损失（如被相关部门处罚、声誉受损等），公司有权要求员工赔偿因此造成的损失。

2. 行政责任：

   • 违反《保障农民工工资支付条例》：根据《保障农民工工资支付条例》的相关规定，农民工工资专户的资金应专款专用，用于支付农民工工资。任何单位和个人不得擅自挪用或改变资金用途。员工配合公司取钱并返回的行为，可能构成对条例的违反，相关部门有权对公司和直接责任人员进行行政处罚，如罚款、责令改正等。同时，若员工被认定为直接责任人员，也可能面临行政处罚。
   • 违反其他行政管理规定：如果此类行为还涉及其他行政管理领域（如税务、金融等），员工还可能因违反相关行政管理规定而承担行政责任。

3. 刑事责任：

   • 挪用资金罪：如果员工配合公司取钱并返回的行为涉及挪用农民工工资专户中的资金，且数额较大、超过三个月未还，或者虽未超过三个月但数额较大、进行营利活动或非法活动，可能构成挪用资金罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，挪用资金罪可处三年以下有期徒刑或者拘役；挪用本单位资金数额巨大的，或者数额较大不退还的，处三年以上十年以下有期徒刑。
   • 其他犯罪：如果此类行为还涉及其他犯罪构成要件（如诈骗、职务侵占等），员工还可能因构成其他犯罪而承担刑事责任。

法律建议：

• 拒绝配合：员工应坚决拒绝公司的此类要求，明确告知公司此类行为违法且可能带来的严重后果。
• 保留证据：如果员工已经遭遇了此类情况，应尽快收集并保留相关证据（如聊天记录、转账记录、公司指令等），以便在必要时维护自己的合法权益。
• 及时举报：员工可以向当地劳动保障监察机构或公安机关举报公司的违法行为，以维护农民工的合法权益和社会的公平正义。

进一步思考：

此类行为不仅损害了农民工的合法权益，也破坏了社会的公平正义和法治秩序。作为员工，应增强法律意识，坚守法律底线，不参与任何违法活动。同时，公司也应加强内部管理，遵守法律法规，确保农民工工资的按时足额支付。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。