在建设工程纠纷中，多层转包的情况下，实际施工人一般可以向发包人主张款项，但需满足一定条件。具体分析如下：

1. 法律依据与实际施工人权益保护
   根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第四十三条，实际施工人（即多层转包后最终完成工程建设的主体）有权突破合同相对性，直接向发包人主张工程款。但需满足两个核心条件：

   • 转包或违法分包行为存在：若转包行为被认定为违法（如未取得发包人同意、转包给无资质主体等），实际施工人可依据该条款主张权利。
     
   • 发包人欠付工程款：实际施工人仅能在发包人欠付转包人或违法分包人工程款的范围内主张权利。若发包人已全额支付，则实际施工人无权再向其主张。

2. 多层转包中的权利行使限制

   • 实际施工人身份认定：需证明自身是实际投入资金、材料和劳动力完成工程建设的主体，而非中间转包环节的“二包”“三包”等。
     
   • 证据要求：需提供施工合同、工程验收单、付款凭证、与转包人的沟通记录等，证明转包关系及自身实际施工事实。
     
   • 诉讼策略：若发包人抗辩已付清款项，实际施工人需举证发包人欠付的具体金额，否则可能承担败诉风险。

3. 例外情形与风险提示

   • 合法分包情形：若转包行为合法（如经发包人同意且分包给有资质主体），实际施工人需依据合同向直接转包人主张权利，一般无法突破合同相对性向发包人索赔。
     
   • 诉讼时效：主张工程款的诉讼时效为3年，自应付款之日起算。若超过时效，发包人可能提出抗辩。
     
   • 工程质量风险：若工程存在质量问题，发包人可能主张抵扣工程款或要求赔偿，实际施工人需提前评估风险。

建议：若您是实际施工人，建议立即收集转包合同、施工记录、付款凭证等证据，并委托律师分析转包行为的合法性、发包人欠付金额等关键问题，以制定最优诉讼策略。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。