结论：公司多给员工发工资，员工未主动说明且被公司查出后，员工通常需要返还多发的工资，但具体处理方式需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、法律层面分析
不当得利返还义务
- 根据《中华人民共和国民法典》第九百八十五条，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。公司多发的工资属于员工没有法律根据取得的不当利益，公司有权要求员工返还。
- 例外情形：若员工能证明多发工资系公司自愿赠与（如书面协议、邮件确认等），则可能无需返还。但实践中此类情形极少，需严格举证。
劳动关系中的特殊规则
- 劳动法领域虽未直接规定多发工资的处理，但根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者原因给用人单位造成损失的，用人单位可要求赔偿，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%。但此条适用于员工过错导致损失的情形，与“被动接收多发工资”性质不同，公司不能直接扣款，需通过协商或法律途径解决。
二、实务操作建议
公司角度
- 沟通协商：优先与员工沟通，说明多发工资的事实及法律依据，要求员工主动返还。沟通时需保留书面记录（如邮件、微信聊天记录）。
- 内部处理：若员工拒绝返还，公司可依据规章制度（如《员工手册》中关于“不当得利处理”的条款）进行内部处理，但需确保制度已通过民主程序制定并公示。
- 法律途径：若协商无果，公司可向法院提起民事诉讼，要求员工返还多发工资。诉讼时需提供工资发放记录、银行流水等证据。
员工角度
- 主动沟通：若发现工资多发，建议主动联系公司说明情况并返还，避免后续纠纷。
- 保留证据：若公司已查出并要求返还，员工可要求公司出具书面说明（如多发工资的具体金额、原因），并核对工资条、银行流水等证据，确保返还金额准确。
- 异议处理：若员工认为多发工资系公司过错（如财务系统故障），且自身无过错，可提出异议并要求公司通过合法途径解决，而非直接扣款。
三、特殊情形处理
员工已离职
- 若员工已离职，公司仍可要求返还多发工资，但需注意诉讼时效（一般为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算）。
- 若员工离职时未结算工资，公司可在结算时直接扣除多发部分，但需提前告知员工并保留书面记录。
公司存在过错
- 若多发工资系公司财务系统故障、工资计算错误等自身原因导致，且员工无过错，公司仍可要求返还，但需注意方式方法，避免侵犯员工权益。
- 若公司因多发工资导致员工生活困难（如员工已将多发工资用于必要支出），公司可与员工协商分期返还或适当减免。
总结：公司多给员工发工资，员工未主动说明且被公司查出后，员工通常需返还多发工资。建议双方优先通过沟通协商解决，若协商无果，公司可依法提起诉讼。员工在处理此类问题时，应保留相关证据并主动沟通，以维护自身合法权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。