结论：外包合同变更后由公司直接管理改为客户管理，通常需要员工本人同意，但具体是否需要取决于合同变更的内容、性质以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：
一、合同变更的法定要求
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则。这意味着，如果外包合同中的管理条款发生变更，涉及到员工的管理方式、工作地点、工作内容等实质性内容时，原则上需要员工本人同意。因为这些变更可能直接影响到员工的权益，如工作环境、薪酬待遇、职业发展等。
二、合同变更的实际情况
如果变更不涉及员工实质性权益：例如，仅仅是管理流程的优化或管理方式的微调，且这些变更不会对员工的工作条件、薪酬待遇等产生实质性影响，那么可能不需要员工本人同意。但即便如此，从维护员工权益和避免劳动纠纷的角度出发，建议公司还是与员工进行充分沟通，确保员工了解并接受这些变更。
如果变更涉及员工实质性权益：如前所述，如果变更涉及到员工的管理方式、工作地点、工作内容等实质性内容，且这些变更可能对员工产生不利影响，那么必须得到员工本人的同意。否则，公司可能面临劳动纠纷和法律责任。
三、法律建议
充分沟通：在变更外包合同的管理条款前，公司应与员工进行充分沟通，解释变更的原因、目的和可能对员工产生的影响。通过沟通，可以增进双方的理解和信任，为变更的顺利实施奠定基础。
签订书面协议：如果员工同意变更合同的管理条款，公司应与员工签订书面协议，明确变更的内容、生效时间以及双方的权利和义务。书面协议是证明双方协商一致的重要证据，有助于避免未来的劳动纠纷。
遵守法律法规：在变更外包合同的管理条款时，公司应严格遵守相关法律法规的规定，确保变更的合法性和合规性。如果变更涉及员工的实质性权益，且未得到员工本人的同意，公司可能面临法律责任和劳动纠纷。
四、可能的法律后果
如果公司未经员工同意擅自变更外包合同的管理条款，且这些变更涉及员工的实质性权益，员工有权向劳动争议调解仲裁机构或人民法院提起诉讼或申请仲裁，要求公司恢复原合同条款或赔偿因此造成的损失。因此，公司在变更外包合同的管理条款时，务必谨慎行事，确保变更的合法性和合规性。
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