结论：包工头出车祸负主责是否与公司有关以及如何赔偿，需分情况讨论，主要取决于包工头与公司之间的法律关系以及事故发生的具体情形。
包工头与公司是劳动关系
- 是否与公司有关：如果包工头与公司签订了劳动合同，存在正式的劳动关系，那么包工头在执行工作任务过程中发生车祸且负主责，这通常会被认定为工伤。此时，公司需要承担相应的工伤保险责任。
- 如何赔偿：根据《工伤保险条例》，公司应按照规定为包工头申请工伤认定，并支付相应的工伤待遇，包括医疗费、停工留薪期工资、伤残补助金等。如果公司未依法缴纳工伤保险费，那么这些费用将由公司自行承担。
包工头与公司是承揽关系或劳务关系
- 是否与公司有关：如果包工头与公司之间是承揽关系或劳务关系，即包工头独立承担工作成果，公司仅支付报酬，那么包工头在从事工作过程中发生车祸且负主责，通常不被视为公司的责任。但是，如果公司对事故的发生存在过错，比如提供了不安全的施工环境或工具，那么公司可能需要承担一定的过错责任。
- 如何赔偿：在这种情况下，赔偿主要依据包工头与事故对方（如其他车辆驾驶员、行人等）之间的侵权责任关系来确定。包工头需要向事故对方赔偿因其主责造成的损失，包括医疗费、误工费、财产损失等。如果公司存在过错，包工头可以要求公司承担相应的赔偿责任。
特殊情况考虑
- 包工头个人行为：如果车祸发生在包工头非工作时间或非执行工作任务过程中，那么这通常被视为包工头的个人行为，与公司无关。此时，赔偿问题将完全由包工头个人承担。
- 第三方责任：如果车祸是由第三方造成的，比如其他车辆驾驶员的违法行为，那么包工头可以向第三方主张赔偿。在这种情况下，公司的责任将取决于其与包工头之间的法律关系以及事故的具体情形。
建议：
- 对于包工头而言，无论与公司是何种法律关系，都应尽快了解事故的具体情况，包括责任划分、损失情况等，并保留好相关证据。
- 如果与公司存在劳动关系，应及时向公司报告事故情况，并申请工伤认定。
- 如果与公司是承揽关系或劳务关系，且认为公司存在过错，可以与公司协商赔偿事宜，或寻求法律途径解决。
- 在处理赔偿问题时，建议咨询专业律师，以确保自身权益得到充分保障。
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