结论：在连带责任一方已经在执行程序中支付了99%款项的情况下，能否只解封此一方，并非一个简单的是非问题，而是需要根据具体情况，结合法律规定和执行实践来综合判断。
分析角度一：法律规定的角度
连带责任的基本原则：
- 连带责任意味着各责任方对债权人承担共同且连带的责任。债权人可以要求任何一方承担全部或部分责任，而该方在承担责任后，有权向其他责任方追偿。
执行程序中的解封规定：
- 在执行程序中，法院会根据债权人的申请和被执行人的履行情况，决定是否对被执行人的财产进行查封、扣押或冻结。
- 如果一方已经履行了大部分或全部债务，债权人可以申请解除对该方的财产保全措施。但这一申请是否得到批准，还需法院根据具体情况进行裁量。
分析角度二：执行实践的角度
法院的裁量权：
- 法院在执行程序中拥有较大的裁量权，会根据案件的具体情况、被执行人的履行情况、债权人的利益保护等因素，综合判断是否解封。
- 如果一方已经支付了99%的款项，且剩余款项的支付不存在争议或障碍，法院可能会考虑解封该方的部分或全部财产。
债权人的意愿：
- 债权人的意愿也是法院考虑的重要因素之一。如果债权人同意解封该方的财产，且这一解封不会损害其合法权益，法院可能会予以批准。
- 但如果债权人坚持要求继续查封，以确保剩余款项的支付，法院可能会尊重债权人的意愿，维持查封状态。
分析角度三：实际操作中的建议
与债权人协商：
- 建议被执行人与债权人进行积极沟通，说明已经支付了大部分款项，并承诺会尽快支付剩余款项。
- 通过协商，争取债权人的同意，共同向法院申请解封部分或全部财产。
向法院提出申请：
- 在与债权人协商无果或债权人不同意解封的情况下，被执行人可以向法院提出解封申请。
- 申请时应提供充分的证据，证明已经履行了大部分债务，且剩余款项的支付不存在问题。
- 法院会根据申请情况和案件具体情况，作出是否解封的决定。
可能存在的风险与后果：
- 如果法院决定不解封，被执行人可能需要继续承担财产被查封的不便和损失。
- 如果被执行人未能按时支付剩余款项，债权人可能会申请恢复执行或采取其他法律措施，对被执行人造成更大的法律压力和经济损失。
总结与建议：
在连带责任一方已经在执行程序中支付了99%款项的情况下，能否只解封此一方，需要根据具体情况和法律规定来综合判断。建议被执行人与债权人积极协商，共同向法院申请解封；如果协商无果，可以向法院提出解封申请，并提供充分的证据支持。同时，被执行人应确保按时支付剩余款项，以避免可能的法律风险和后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。