针对您提出的问题，即工伤起诉时用工所在地和用人单位所在地不在一个市，是否可以去公司注册地起诉，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，在工伤认定及后续可能的法律程序中，管辖地的确定通常与劳动合同履行地和用人单位所在地有关。劳动合同履行地，简单来说，就是劳动者实际工作的地方；而用人单位所在地，则是用人单位注册、登记地或者主要办事机构所在地。

针对您的情况，如果工伤事故发生在用工所在地，而该地与用人单位注册地不在同一个市，那么根据相关规定和实际操作经验，您并不一定要去公司注册地起诉或申请工伤认定。实际上，根据《工伤保险条例》以及人力资源社会保障部《关于执行<工伤保险条例>若干问题的意见》(二)的相关规定，未参加工伤保险的职工，应当在生产经营地（即劳动合同履行地）进行工伤认定、劳动能力鉴定，并按照生产经营地的规定依法由用人单位支付工伤保险待遇。

此外，从劳动争议仲裁的角度来看，如果双方当事人分别向劳动合同履行地和用人单位所在地的仲裁委员会申请仲裁，那么由劳动合同履行地的仲裁委员会管辖。这一规定同样体现了对劳动者实际工作地的重视和保护。

具体到您的情况，如果工伤事故发生在用工所在地，且该地有明确的劳动合同履行地（即您实际工作的地方），那么您应该首先考虑在该地进行工伤认定和可能的法律程序。当然，如果公司注册地有更便利的条件或者您有其他特殊考虑，也可以咨询当地律师或法律机构，了解是否有可能在公司注册地进行相关程序。

总的来说，在工伤起诉或申请工伤认定时，您并不一定要去公司注册地，而是可以根据实际情况选择在劳动合同履行地（即用工所在地）进行。这样不仅可以更方便地收集证据和进行法律程序，也更有利于保护您的合法权益。希望这个解答能够对您有所帮助。