结论：关于在公司工作12年休2天病假是否扣钱的问题，这主要取决于公司的规章制度以及您与公司的劳动合同中的相关约定，同时也受到国家法律法规的约束。一般情况下，如果符合病假条件且公司规章制度或劳动合同未作特殊规定，公司不应扣减病假期间的工资。以下是对此问题的详细分析：
一、法律法规层面
病假工资支付规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及相关劳动法律法规，员工在病假期间，公司应当按照一定比例支付病假工资或疾病救济费。具体比例可能因地区和公司政策而异，但通常不会低于当地最低工资标准的80%。
医疗期保护：
- 员工在医疗期内，公司不得随意解除劳动合同，且应当支付病假工资。医疗期的长短根据员工的工作年限和在本单位的工作年限来确定，对于工作12年的员工，医疗期通常会相对较长。
二、公司规章制度与劳动合同层面
公司规章制度：
- 公司可能会制定自己的病假管理制度，包括病假的申请流程、病假工资的支付标准等。如果公司的规章制度中明确规定了病假不扣工资，那么您休病假期间就不会扣钱。
- 如果公司规章制度中未明确规定或规定与法律法规相冲突，则应以法律法规为准。
劳动合同约定：
- 您与公司在签订劳动合同时，可能会就病假工资的支付问题进行约定。如果劳动合同中明确规定了病假期间的工资支付标准，那么应按照劳动合同的约定执行。
- 如果劳动合同中未约定或约定不明确，则应参照公司规章制度和法律法规的规定。
三、实际操作建议
查阅公司规章制度和劳动合同：
- 首先，建议您查阅公司的规章制度和与公司的劳动合同，了解其中关于病假工资支付的具体规定。
与公司沟通：
- 如果您对病假工资的支付有疑问或认为公司扣减了不合理的工资，可以与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解具体情况并寻求解决方案。
寻求法律援助：
- 如果公司拒绝支付病假工资或扣减了不合理的工资，且您认为自己的权益受到了侵害，可以寻求法律援助或向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁。
举例说明：假设您所在的公司规章制度中明确规定了病假期间工资按正常工资的80%支付，且您的劳动合同中也未对此进行特殊约定。那么，在您休2天病假期间，公司应当按照您正常工资的80%支付病假工资，而不应全额扣减。
最后建议：如果您对病假工资的支付问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。作为专注于劳动纠纷领域的律师，我将竭诚为您提供专业的法律意见和帮助。