招标代理公司发售标书收费的法律依据主要来源于《中华人民共和国招标投标法实施条例》及相关政策文件，具体分析如下：
《中华人民共和国招标投标法实施条例》第十六条：
- 该条款明确规定，招标人发售资格预审文件、招标文件收取的费用应当限于补偿印刷、邮寄的成本支出，不得以营利为目的。这一规定为招标代理公司发售标书收费提供了基本的法律框架，即收费必须合理，且仅限于覆盖实际成本。
国家发展改革委的政策文件：
- 自2015年起，国家发展改革委发布《关于进一步放开建设项目专业服务价格的通知》（发改价格〔2015〕299号），招标代理服务收费实行市场调节价。这意味着，招标代理公司发售标书的收费不再执行原有的固定收费标准，而是由招标人和招标代理机构根据市场情况协商确定。这一政策变化赋予了招标代理公司更大的定价自主权，但同时也要求其收费必须更加透明和合理。
行业规定与惯例：
- 尽管国家放开了招标代理服务价格，但行业内可能仍存在一些约定俗成的收费标准或惯例。这些惯例虽不具有强制性，但在实际操作中往往被广泛接受和应用。例如，根据项目的复杂程度、文件页数、装订要求等因素，招标代理公司可能会制定相应的收费标准。然而，这些标准必须符合《中华人民共和国招标投标法实施条例》中关于成本补偿的原则。
招标文件中的约定：
- 在具体的招标项目中，招标人会通过招标文件明确规定招标代理费的支付方式、金额或计算方式。投标人参与投标时，即视为接受这些条款。因此，招标文件也是确定招标代理公司发售标书收费的重要依据之一。如果招标文件中规定了标书费用，投标人需要按照规定支付。
在实际操作中，招标代理公司发售标书收费时还需注意以下几点：
- 合理性原则：收费必须与实际成本挂钩，不得超标准收费或以费用为门槛限制竞争。例如，文件页数、装订费、邮寄费等应作为收费的参考依据。
- 透明性原则：招标代理公司应在招标文件中明确标书费用的金额、支付方式及退费条件（如有），以确保投标人的知情权。
- 合规性原则：招标代理公司应遵守相关法律法规和政策文件的规定，不得违反成本补偿原则或以营利为目的收取过高费用。
举例说明：
假设某招标代理公司负责一个工程类项目的招标工作，其发售的招标文件包括纸质版和电子版。根据行业惯例和实际成本考虑，该公司可能规定纸质版招标文件收费200元/份（包括印刷和装订费用），电子版招标文件免费或低价提供（如50元/份，仅覆盖下载链接的维护成本）。这样的收费标准既符合成本补偿原则，又体现了市场调节价的特点。
总结与建议：
招标代理公司发售标书收费的法律依据主要来源于《中华人民共和国招标投标法实施条例》及相关政策文件。在实际操作中，招标代理公司应遵守合理性、透明性和合规性原则，确保收费合理且符合市场规律。同时，招标人应在招标文件中明确标书费用的相关条款，以避免后续产生纠纷。如果您在招标代理或相关领域遇到法律问题，欢迎直接向我咨询。