招标代理公司收取定标费（通常理解为招标代理费的一部分）的合法性，需根据具体情况及合同约定来判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律法规基础：

   • 《中华人民共和国招标投标法》及相关实施条例并未明确规定招标代理费的具体承担主体或收费标准，而是为招标活动双方提供了自主协商的空间。这意味着，招标代理费的收取方式和承担主体并非由法律强制规定，而是可以通过合同约定来确定。

2. 常规做法与合同约定：

   • 在大多数情况下，招标代理费由招标人承担，因为招标人是招标活动的发起者和受益者。然而，如果招标文件或合同中有明确规定招标代理费由中标人支付，并且这一约定清晰、无歧义，不违反法律法规的强制性规定，那么招标代理公司向中标人收取定标费（即招标代理费的一部分）是合法的。
   • 关键点：招标文件或合同中的约定必须明确、具体，且不得存在不合理的歧视性或排他性条款，以确保招投标活动的公平、公正和公开。

3. 实际操作建议：

   • 招标人角度：在招标前，招标人应明确招标代理费的承担方式，并在招标文件中清晰表述。这有助于避免后续产生不必要的纠纷，并确保招投标活动的顺利进行。
   • 中标人角度：中标人在参与投标时，应仔细审查招标文件中的相关条款，特别是关于招标代理费的承担方式。如有疑虑，应及时提出质疑或咨询专业律师，以确保自身权益不受损害。
   • 招标代理公司角度：招标代理公司应遵循诚信、公正的原则，合理确定服务费用，并在合同中明确约定收费标准、支付方式及支付主体等关键信息。这有助于维护市场秩序和当事人的合法权益。

4. 可能的风险与后果：

   • 如果招标文件或合同中未明确约定招标代理费的承担方式，或者约定不明确导致争议，可能引发后续纠纷和风险。例如，中标人可能拒绝支付招标代理费，或者招标人可能要求中标人承担额外的费用。
   • 在这种情况下，各方应通过合法途径解决纠纷，如协商、调解、仲裁或诉讼等。为了避免这种情况的发生，建议在招标前就明确费用承担方式，并在合同中详细约定。

总结来说，招标代理公司收取定标费的合法性取决于招标文件、合同条款以及相关法律法规的具体规定。在实际操作中，建议各方遵循法律法规和行业惯例，确保费用承担方式的明确性、合理性和合法性。如果您在招投标活动中遇到相关问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我将竭诚为您提供专业的法律服务。