在固定总价包干合同中，能否扣款需视具体情况而定，核心在于合同约定及未完成项目的原因。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合同有明确约定时

   • 明确扣减：若合同中明确规定了未完成项目的扣款方式及计算依据，例如按未做项目在投标报价中的占比扣减，那么应严格依照合同执行。比如，合同中约定某部分工程未完成，将从总价中扣除该部分工程预算的20%作为违约金或损失赔偿，这种情况下，业主有权按照约定进行扣款。
   • 不扣减情况：若合同中有特别约定，如只要完成主要目的和关键工作，附属、次要项目未做不影响整体工程交付使用可不扣减，也应遵守该约定。例如，合同中明确某些装饰性工程未完成不影响整体使用和验收，那么业主就不能因这些未完成项目而扣款。

2. 合同无明确约定时

   • 承包商原因导致未做：若因承包商自身原因（如施工组织不力、资金短缺、技术不过关等）导致项目未完成，业主有权要求从总价中扣除未做项目的合理价款。这通常包括成本加上合理利润，具体数额可能需要根据市场行情、行业惯例或专业评估来确定。比如，承包商因自身管理不善导致某部分工程延期且最终未完成，业主可以要求扣除该部分工程的成本及预期利润。
   • 非承包商原因导致未做：
     • 业主原因：如业主提出设计变更、提供资料不及时或未按时支付工程款等导致项目未做，承包商有权要求业主补偿因变更造成的损失，而非简单扣减费用。例如，业主在施工过程中突然要求变更设计方案，导致部分已施工的工程需要拆除重建，且新方案下的部分工程未做，这种情况下业主应补偿承包商因此产生的额外费用，而不是从总价中扣款。
     • 不可抗力：因不可抗力（如自然灾害、战争、政府行为等）导致部分项目无法完成，双方应公平合理地分担损失。通常不会直接从总价中扣除未做项目费用，而是协商解决，如延长工期、调整工作内容或分担额外费用等。比如，因极端天气导致部分室外工程无法施工，双方可以协商延长工期或调整施工计划，而不是直接扣款。

3. 实际操作中的建议

   • 在处理固定总价包干合同中的扣款问题时，除了严格遵循合同约定外，还需考虑实际操作的复杂性。双方应通过友好沟通，了解未完成工作的具体原因及双方意见，寻求都能接受的解决方案。
   • 若遇到复杂情况或争议较大，建议及时整理相关证据材料，如合同文本、施工记录、变更通知、沟通记录等，以便更准确地分析法律责任和权益。

总结与提醒：固定总价包干合同中的扣款问题并非一概而论，而是需要根据合同约定、未完成项目的原因及实际情况来综合判断。在签订合同时，建议双方尽可能明确约定未完成项目的处理方式及扣款标准，以减少后续争议。若您在处理此类问题时遇到困惑或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。