公交公司只发当月百分之五十工资，这一行为是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：
若公司因经营困难或特殊原因，与劳动者协商一致后降低工资：
- 根据《劳动合同法》及相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工资标准。因此，如果公交公司因经营困难或其他特殊原因，与劳动者进行了充分的沟通并达成一致，决定暂时降低工资至当月的百分之五十，且这一决定不违反法律法规的强制性规定，也不损害劳动者的基本生活需求，那么这一行为在法律上是允许的。但公司应当确保这一降低是暂时的，并在条件改善后及时恢复原工资水平。
若公司未经协商，单方面降低工资：
- 如果公交公司未经与劳动者协商，单方面决定只发当月百分之五十的工资，这一行为则可能构成违法。根据《劳动合同法》第三十条和第三十八条的规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果用人单位未及时足额支付劳动报酬，劳动者有权要求用人单位支付，并可以解除劳动合同，同时要求用人单位支付经济补偿。
特殊情况下的工资支付：
- 在某些特殊情况下，如劳动者因病或非因工负伤在规定的医疗期内，或者女职工在孕期、产期、哺乳期内等，用人单位应当按照国家规定支付相应的工资或生活费，不得随意降低。如果公交公司在这些特殊情况下仍然只发当月百分之五十的工资，那么这一行为显然是违法的。
法律建议：
- 对于劳动者：如果发现公交公司未经协商单方面降低工资，或者降低后的工资无法满足基本生活需求，应当及时与公司进行沟通协商，要求恢复原工资水平或支付足额的工资。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 对于公交公司：应当严格遵守国家法律法规和劳动合同约定，确保劳动者的工资得到及时足额支付。如果因经营困难或其他特殊原因需要降低工资，应当与劳动者进行充分沟通并达成一致，同时确保降低后的工资不低于当地最低工资标准，以保障劳动者的基本生活需求。
可能后果：
- 如果公交公司未经协商单方面降低工资，且劳动者因此提出解除劳动合同并要求经济补偿的，公交公司可能需要承担相应的法律责任，包括支付经济补偿等。
- 如果公交公司的行为被认定为违法，还可能面临劳动监察部门的处罚和劳动者的诉讼风险。
总之，公交公司只发当月百分之五十工资是否合法，取决于是否与劳动者协商一致以及是否违反法律法规的强制性规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。