有隶属关系的机关之间是可以发函的。这一行为在行政管理和法律实践中是常见且合法的，以下从几个角度进行详细分析：

1. 行政隶属关系与发函的合法性：

   • 在行政体系中，机关之间往往存在隶属关系，这种关系体现了行政管理的层级性和统一性。发函作为机关之间沟通、协调、指示或报告的一种方式，是行政管理活动的重要组成部分。
   • 隶属关系的机关之间发函，通常是为了传达上级机关的指示、要求下级机关执行某项任务、报告工作进展或情况等。这种发函行为是基于行政管理的需要，具有明确的合法性和正当性。

2. 发函的具体形式和内容：

   • 发函的形式可以多样，包括但不限于正式公文、便函、通知等。具体形式的选择通常取决于发函的目的、紧急程度以及机关之间的惯例。
   • 发函的内容应当明确、具体，符合法律法规和行政管理的规定。例如，上级机关向下级机关发函时，应当明确指示或要求的内容、执行的标准和期限等；下级机关向上级机关发函时，应当如实报告工作进展、存在的问题或建议等。

3. 发函的法律依据：

   • 虽然具体的法律法规可能并未直接规定隶属关系的机关之间可以发函，但根据《中华人民共和国行政法》及相关行政法规的原则和精神，机关之间为了履行行政管理职责、实现行政管理目标，有权进行必要的沟通和协调。
   • 发函作为机关之间沟通协调的一种方式，其合法性来源于行政管理的需要和法律法规的授权。只要发函行为符合法律法规的规定和行政管理的原则，就是合法的。

4. 实际案例与操作建议：

   • 在实际工作中，隶属关系的机关之间发函是普遍存在的现象。例如，上级政府部门向下级政府部门发函要求加强某项工作的管理，或者下级政府部门向上级政府部门报告工作进展和存在的问题等。
   • 对于机关之间发函的具体操作，建议遵循以下原则：一是发函应当基于实际需要，避免不必要的发函；二是发函内容应当明确、具体、合法；三是发函应当遵循规定的程序和格式，确保发函的正式性和有效性。

总结与建议：有隶属关系的机关之间发函是合法且常见的行政管理行为。在实际操作中，机关应当根据实际需要发函，并确保发函内容的明确性、具体性和合法性。如果对发函的具体操作或法律后果存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。