结论：事业单位人员醉驾若检察院不起诉，能否保留工作需分情况讨论，主要取决于单位内部规章制度及醉驾行为是否造成严重后果或社会影响。

1. 检察院不起诉的法律意义
   根据《刑事诉讼法》第177条，检察院作出不起诉决定意味着行为不构成犯罪或情节轻微不需追究刑责。此时，当事人不会留下刑事犯罪记录（即“无罪”状态），但可能面临行政处罚（如吊销驾照、罚款、拘留等）。

2. 事业单位人员管理的特殊性
   事业单位人员受《事业单位工作人员处分暂行规定》约束，该规定明确：

   • 若醉驾行为被认定为“违反国家法律法规”，单位可给予警告、记过、降低岗位等级、撤职或开除处分；
     
   • 若醉驾导致严重后果（如交通事故致人伤亡）或引发重大社会影响，单位通常会从严处理，甚至直接开除。

3. 检察院不起诉后的处理逻辑

   • 单位无明确规章制度：若单位未在内部规定中明确“醉驾即开除”，且行为未造成严重后果，检察院不起诉后，单位可能仅给予行政警告或记过处分，保留工作；
     
   • 单位有明确规章制度：若单位规定“醉驾一律开除”或“因违法行为受行政处罚即开除”，则即使检察院不起诉，单位仍可能依据内部规定解除劳动关系；
     
   • 行为后果严重性：若醉驾导致交通事故、逃逸、抗拒执法等情节，即使检察院不起诉，单位也可能以“严重违反职业道德”或“损害单位声誉”为由开除。

4. 实务建议

   • 主动沟通单位：在检察院作出不起诉决定后，建议第一时间与单位人事部门沟通，说明情况并提交不起诉决定书，争取从轻处理；
     
   • 核查内部规定：仔细查阅单位《员工手册》或《处分条例》，确认是否有针对醉驾的明确处罚条款；
     
   • 争取行政复议或申诉：若单位拟开除且依据不足，可依法申请劳动仲裁或向主管部门申诉，主张处分过重。

总结：检察院不起诉为保留工作提供了有利条件，但最终结果需结合单位规定和行为后果综合判断。建议根据具体情况制定应对策略，必要时可进一步向我咨询具体操作方案。