综合工时制下，员工在特定情况下是有加班费的。下面我将从综合工时制的定义、加班费的计算方式以及相关法律规定等角度，为您详细解释：

1. 综合工时制的定义：

   • 综合工时制是一种特殊的工作时间制度，它允许用人单位根据生产、工作的特点，对劳动者的工作时间进行灵活安排。在综合计算周期内（如周、月、季、年等），劳动者的总工作时间可以超过标准工作时间，但平均每天或每周的工作时间应与法定标准工作时间基本相同。

2. 加班费的计算方式：

   • 在综合工时制下，加班费的计算并非简单地按照每天或每周的加班时间来计算，而是基于整个综合计算周期内的总工作时间。
   • 如果劳动者在综合计算周期内的总工作时间超过了法定标准工作时间，那么超出部分应视为加班，用人单位应按照法律规定支付加班费。
   • 加班费的具体计算方式通常根据劳动合同或集体合同的约定，以及当地劳动法律法规的规定来确定。一般来说，加班费会按照劳动者小时工资的一定比例（如150%、200%、300%）来支付，具体比例取决于加班的时间段（如工作日、休息日、法定节假日）。

3. 相关法律规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位在实行综合工时制时，必须确保劳动者的平均工作时间不超过法定标准工作时间，并且应依法支付加班费。
   • 如果用人单位未按照法律规定支付加班费，劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。

举例说明： 假设一个劳动者与用人单位约定了以月为周期的综合工时制，且该劳动者的小时工资为50元。在某个月内，该劳动者实际工作了200小时，而法定标准工作时间为176小时（假设每月工作22天，每天8小时）。那么，该劳动者超出的工作时间为24小时，这24小时应视为加班时间。根据法律规定，如果这24小时是在工作日加班的，加班费应为\(50元/小时 \times 24小时 \times 150\% = 1800元\)；如果是在休息日加班且未安排补休的，加班费应为\(50元/小时 \times 24小时 \times 200\% = 2400元\)；如果是在法定节假日加班的，加班费应为\(50元/小时 \times 24小时 \times 300\% = 3600元\)。具体计算方式还需根据劳动合同或集体合同的约定以及当地劳动法律法规的规定来确定。

建议：

• 如果您所在的工作单位实行综合工时制，建议您仔细阅读劳动合同或集体合同中关于工作时间的条款，了解自己的工作时间安排和加班费的计算方式。
• 如果您发现用人单位未按照法律规定支付加班费，或者对加班费的计算方式有疑问，可以及时向用人单位提出异议，并保留好相关证据（如工作记录、考勤表等），以便在需要时维护自己的合法权益。

如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。