员工违反保密协议是否属于劳动争议，这主要取决于保密协议的签订时间、背景以及协议双方的主体身份。以下是对此问题的详细分析：
一、属于劳动争议的情况
签订时间与背景：
- 若保密协议是在劳动关系存续期间签订，且作为劳动合同的附件或与劳动合同有紧密关联，那么员工违反保密协议通常会被视为劳动争议。
协议内容：
- 保密协议主要涉及因履行劳动权利义务而产生的保密义务，如员工在工作过程中知悉的用人单位的商业秘密、技术秘密等。
法律依据与处理流程：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守商业秘密和与知识产权相关的保密事项。员工违反保密协议时，用人单位可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求员工承担违约责任、赔偿损失等。对仲裁裁决不服的，可在规定时间内向人民法院提起诉讼。
实际案例：
- 在实际案例中，员工离职后泄露原单位的商业秘密或技术秘密，给原单位造成经济损失，此类案件通常被视为劳动争议，并按照劳动争议相关程序处理。
二、不属于劳动争议的情况
签订时间与背景：
- 若保密协议是在劳动关系结束后单独签订，或虽在劳动关系存续期间签订但并非作为劳动合同的附件或紧密关联部分，那么员工违反保密协议可能更倾向于被视为一般的民事合同纠纷。
协议主体：
- 如果签订保密协议的主体并非用人单位与劳动者，如企业之间签订的保密协议，那么此类纠纷也不属于劳动争议。
法律依据与处理流程：
- 对于非劳动关系主体间或劳动关系结束后的保密协议纠纷，应适用《中华人民共和国民法典》等民事法律规范进行处理。当事人可直接向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，按照民事法律规定追究违约方的责任。
三、总结与建议
明确协议性质：
- 在处理员工违反保密协议的纠纷时，首先应明确保密协议的签订时间、背景及协议双方的主体身份，以确定纠纷的性质。
依据法律处理：
- 对于属于劳动争议的情况，应按照劳动争议相关程序处理；对于不属于劳动争议的情况，则应按照民事法律规范进行处理。
完善协议条款：
- 建议用人单位在签订保密协议时，明确协议的内容、范围及违约责任等关键条款，以确保协议的合法性和有效性。同时，员工在签订保密协议时也应仔细阅读协议条款，了解自己的权利和义务。
寻求法律帮助：
- 如果在处理此类纠纷时遇到法律难题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，员工违反保密协议是否属于劳动争议需根据具体情况判断，并依据相关法律法规进行妥善处理。在处理过程中，应明确双方的权利义务关系，确保争议得到公正、合理的解决。