核心结论：工伤九级员工向公司辞职并申请赔偿金，需先确认劳动关系终止，再通过工伤保险基金和用人单位分别申请相应赔偿，具体流程和赔偿项目如下：

1. 确认劳动关系终止
   根据《工伤保险条例》第三十七条，工伤九级员工主动辞职属于“劳动合同期满终止，或者职工本人提出解除劳动合同”的情形，此时可依法享受一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金。

   • 操作建议：提前30日以书面形式向公司提交《辞职通知书》，明确离职日期及原因（如“因工伤九级，现依据《工伤保险条例》第三十七条提出解除劳动合同”），并保留送达证据（如邮寄回执、签字确认单）。

2. 申请工伤保险基金赔偿
   需向当地社保部门申请一次性工伤医疗补助金，具体流程：

   • 材料准备：工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论书、身份证、银行卡、辞职证明等；
     
   • 申请时限：离职后1年内提出；
     
   • 赔偿标准：由省级政府规定（如广东省为9个月本人工资），以当地最新政策为准。
     
   • 操作建议：直接联系公司人事部门协助办理，或自行前往社保局窗口提交材料。

3. 向公司主张一次性伤残就业补助金
   此项赔偿由公司支付，标准同样由省级政府规定（如广东省为4个月本人工资）。

   • 操作建议：
     
     • 离职前与公司协商赔偿金额及支付时间，并签订书面协议；
       
     • 若公司拒绝支付，可向劳动仲裁委员会申请仲裁（需提交劳动合同、工伤认定书、劳动能力鉴定结论、辞职证明等证据）；
       
     • 仲裁时效为离职后1年内。

4. 其他可主张的赔偿

   • 停工留薪期工资：若离职前未足额领取，可要求公司补发（期限以医嘱或劳动能力鉴定结论为准）；
     
   • 医疗费、护理费等：若离职前未报销完毕，可一并主张。
     

注意事项：

• 赔偿金额中的“本人工资”指工伤前12个月平均缴费工资，若实际工资低于统筹地区职工平均工资60%，按60%计算；高于300%的，按300%计算。
  
• 若公司未缴纳工伤保险，所有赔偿（包括一次性工伤医疗补助金）均由公司承担。
  
• 各地政策可能有差异，建议以当地社保局或劳动仲裁部门解释为准。
  

如有具体细节需进一步分析（如公司拒绝赔偿、赔偿金额争议等），可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细解决方案。