以扣留资料要挟付工资的行为确实违法，您可以通过以下方式自证清白并维护自身权益：

1. 明确违法性
   根据《劳动合同法》第九条及第三十条，用人单位不得以任何非法手段（如扣押证件、财物或资料）强迫劳动者提供劳动或支付费用。若对方以扣留资料为条件索要工资，已涉嫌违反《劳动合同法》第八十四条（扣押劳动者财物）及《治安管理处罚法》第四十九条（敲诈勒索），您有权通过法律途径维权。

2. 自证清白的关键步骤

   • 固定证据链：
     
     • 保存对方扣留资料的书面通知、聊天记录、录音录像等直接证据；
       
     • 整理工资发放记录（如银行流水、工资条）、劳动合同、考勤记录等，证明您已履行劳动义务；
       
     • 若对方曾承认扣留行为（如短信、邮件），需重点留存。
       
   • 证明资料归属：
     
     • 若资料属于您个人所有（如学历证书、职业资格证书），提供原件或复印件的公证证明；
       
     • 若资料属于公司但您合法持有（如工作文件），需证明其与劳动义务的关联性（如项目合同、审批流程记录）。
       
   • 反驳对方主张：
     
     • 若对方声称“未付工资所以扣留资料”，需指出工资支付与资料返还是独立法律关系，用人单位无权以违法手段主张权利；
       
     • 若对方主张“资料涉及商业秘密”，需证明您已采取合理保密措施（如签署保密协议、限制接触范围），且扣留行为超出必要限度。

3. 维权途径

   • 向劳动监察部门投诉：
     携带证据向当地劳动保障监察大队举报，要求责令对方返还资料并支付工资，同时可申请行政处罚（如罚款）。
     
   • 申请劳动仲裁：
     若涉及工资争议，可一并主张拖欠工资、经济补偿金等，并要求确认对方扣留行为违法。
     
   • 提起民事诉讼：
     若资料被损毁或泄露造成损失，可起诉要求赔偿；若对方行为涉嫌敲诈勒索，可向公安机关报案。

行动建议：

• 优先通过书面形式（如律师函）要求对方返还资料，明确告知其违法性及后果；
  
• 若对方拒不配合，立即启动法律程序，避免证据灭失；
  
• 全程保持冷静，避免与对方发生直接冲突，所有沟通留痕。
  

如有进一步细节需要分析（如资料类型、对方具体行为模式），可随时补充说明，我将为您定制更具体的应对方案。