结论：干满三个月当天离职是否扣工资，需根据具体情况判断，主要取决于离职原因、公司规章制度以及劳动合同的约定。以下从不同角度进行分析：

1. 合法离职且公司无过错：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。若您已干满三个月，不属于试用期，但若您提前三十日以书面形式通知了公司，并在离职当天办理了离职手续，公司无权扣发工资。
   • 实际操作：若公司规章制度或劳动合同中未规定离职需提前更长时间通知，或您已按照法律规定提前通知，公司扣发工资则属于违法行为。

2. 未提前通知或违反公司规章制度离职：

   • 法律依据：虽然法律未直接规定未提前通知离职需扣工资，但公司可能通过规章制度或劳动合同约定，对未提前通知离职的员工进行一定的经济处罚。然而，这种处罚必须合理，且不能违反法律法规的强制性规定。
   • 实际操作：若公司规章制度或劳动合同中明确规定了未提前通知离职的处罚措施，且该措施不违反法律法规，公司可能据此扣发部分工资。但扣发的金额应合理，且不能超过您当月工资的20%，同时扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。若公司扣发工资超出合理范围或违反法律法规，您有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

3. 公司存在违法行为或过错：

   • 法律依据：若公司存在未按时支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等违法行为，您有权依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿。在此情况下，公司无权扣发工资。
   • 实际操作：若您因公司违法行为而离职，应收集相关证据（如工资条、社保缴纳记录等），并向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

建议：

• 在离职前，务必仔细阅读公司规章制度和劳动合同，了解离职的相关规定和流程。
• 若决定离职，应提前与公司沟通，并按照法律规定或公司规定提前通知。
• 若公司扣发工资，应与公司协商解决；协商无果的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

可能后果：

• 若公司合法扣发工资，您需接受并按照公司规定处理。
• 若公司违法扣发工资，您有权要求公司补发工资，并可能获得经济补偿或赔偿金。

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