结论：
- 综合工时加班超过36小时安排调休的合法性：在综合计算工时制下，若加班时间未超过法定上限，安排调休是合法的；但若加班时间超过法定上限，则安排调休可能不合法，且用人单位需支付加班费。
- 员工是否可以拒绝调休：员工在一般情况下不能拒绝用人单位的合法调休安排，但在特定情况下（如调休时间不合理、影响个人生活等），可以与用人单位协商或寻求法律途径解决。
详细分析：
一、综合工时加班超过36小时安排调休的合法性
综合计算工时制的特点：
- 综合计算工时制是一种特殊的工时制度，它允许用人单位根据生产、工作的特点，采用以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的方式。
- 在这种制度下，劳动者的平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同，即每日不超过8小时，每周不超过40小时。
加班时间的限制：
- 根据相关法律法规，综合计算工时制下的加班时间也受到严格限制。一般来说，在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。
- 若超过，则超过部分应视为延长工作时间，并按照规定支付加班费。对于延长工作时间的限制，通常规定为每日不超过3小时，每月不超过36小时（但这一限制可能因地区或行业而有所不同，需以当地具体规定为准）。不过，在综合计算工时制下，更关注的是整个周期内的总工作时间，而非单日或单月的加班时间。但无论如何，加班时间都不能无限制地延长。
调休的合法性：
- 在综合计算工时制下，若加班时间未超过法定上限，用人单位安排调休是合法的。调休可以视为对劳动者加班的一种补偿方式。
- 但若加班时间超过法定上限，则用人单位不仅应支付加班费，而且其安排的调休可能因违反法律法规而无效。因为此时劳动者的权益已经受到侵害，调休无法完全弥补这种侵害。
二、员工是否可以拒绝调休
一般情况下的调休安排：
- 在用人单位合法安排调休的情况下，员工通常不能拒绝。因为调休是用人单位对劳动者工作时间的一种合理安排，也是劳动者应尽的义务之一。
特定情况下的拒绝权：
- 如果调休时间不合理（如安排在劳动者的重要个人事务期间）、影响劳动者的个人生活或健康等，劳动者可以与用人单位协商调整调休时间。
- 若协商无果，劳动者可以寻求劳动争议调解、仲裁或诉讼等法律途径解决。但需要注意的是，直接拒绝调休可能构成违约或违反用人单位规章制度的行为，因此应谨慎处理。
建议：
- 对于用人单位而言，应严格遵守相关法律法规关于加班时间和调休的规定，确保劳动者的合法权益不受侵害。
- 对于劳动者而言，在面对用人单位的调休安排时，应首先了解自己的权益和用人单位的规章制度。若认为调休安排不合理或侵犯了自己的权益，可以与用人单位协商或寻求法律途径解决。
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