在高标准农田建设项目中，若施工方存在违法转包行为，有权实施行政处罚的部门主要是县级以上地方人民政府住房和城乡建设主管部门。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国建筑法》第六十七条：“承包单位将承包的工程转包的，或者违反本法规定进行分包的，责令改正，没收违法所得，并处罚款，可以责令停业整顿，降低资质等级；情节严重的，吊销资质证书。同时，该法还规定，对因转包工程或者违法分包的工程不符合规定的质量标准造成的损失，与接受转包或者分包的单位承担连带赔偿责任。”虽然该法条并未直接指明处罚部门，但结合建筑行业的监管实践，通常是由县级以上地方人民政府住房和城乡建设主管部门负责此类违法行为的查处。

二、部门职责

县级以上地方人民政府住房和城乡建设主管部门在建筑市场中扮演着重要的监管角色。它们负责监督建筑市场的秩序，确保建筑活动的合法性和规范性。对于违法转包等违法行为，这些部门有权进行调查、取证，并根据调查结果作出相应的行政处罚决定。

三、处罚措施

对于违法转包行为，住房和城乡建设主管部门可以采取多种处罚措施，包括但不限于：

1. 责令改正：要求施工方立即停止违法转包行为，并恢复原状或采取其他补救措施。
2. 没收违法所得：对施工方因违法转包而获得的非法收益进行没收。
3. 罚款：根据违法情节的严重程度，对施工方处以一定数额的罚款。
4. 责令停业整顿：对于情节严重的违法转包行为，可以责令施工方停业整顿一段时间，以进行整改和反思。
5. 降低资质等级：对于多次违法或情节特别严重的施工方，可以降低其建筑资质等级，限制其未来的建筑活动。
6. 吊销资质证书：在极端情况下，如果施工方的违法转包行为造成了严重后果或屡教不改，可以吊销其建筑资质证书，彻底剥夺其从事建筑活动的资格。

四、实际操作建议

在实际操作中，如果发现高标准农田建设项目中存在违法转包行为，可以向当地县级以上地方人民政府住房和城乡建设主管部门进行举报或投诉。这些部门将会对举报或投诉进行调查，并根据调查结果作出相应的处理决定。

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