可以申诉，但能否成功取决于公司规章制度合法性及调休具体情况。以下从不同角度为你详细分析：
从公司规章制度合法性角度
- 若公司规章制度合法且已公示
- 情况说明：公司有权根据自身经营管理的需要制定规章制度，其中包括考勤管理、调休和罚款等相关规定。如果公司的规章制度是依法制定的，即经过了民主程序（如职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定），并且已经向员工进行了公示或者告知，那么该规章制度对员工具有约束力。
- 申诉结果：在这种情况下，如果你不请假自行调休，违反了公司的规章制度，公司依据合法有效的规章制度对你进行罚款，你申诉成功的可能性较小。不过，即使规章制度合法，公司罚款的金额也应当合理，不能超过法定限度。根据相关法律规定，用人单位从劳动者工资中扣除赔偿费用，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 若公司规章制度不合法或未公示
- 情况说明：如果公司的规章制度没有经过民主程序制定，或者没有向员工进行公示、告知，那么该规章制度对员工不具有约束力。公司不能依据不合法的或者未公示的规章制度对员工进行罚款。
- 申诉结果：此时，你有较大的申诉成功可能性。你可以向公司提出申诉，说明公司的规章制度存在问题，要求公司撤销罚款决定。如果公司拒绝撤销，你可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
从调休具体情况角度
- 因特殊原因自行调休且事后及时说明
- 情况说明：如果你因为突发疾病、家庭紧急事务等特殊原因，无法事先请假而自行调休，并且在事后及时向公司说明了情况，提供了相关证明材料（如医院诊断证明、事故处理证明等），那么公司应该根据实际情况予以理解和处理。
- 申诉结果：在这种情况下，公司对你进行罚款是不合理的，你申诉成功的可能性较大。你可以与公司沟通协商，要求公司撤销罚款决定。如果协商不成，你可以通过劳动争议处理程序来解决。
- 无正当理由自行调休
- 情况说明：如果你没有合理的理由，擅自不请假自行调休，这种行为违反了公司的考勤制度和劳动纪律。
- 申诉结果：如果公司的规章制度合法有效且已公示，那么公司对你进行罚款是有依据的，你申诉成功的难度较大。不过，你仍然可以尝试与公司沟通，说明自己的情况，争取公司的谅解和减轻处罚。
建议：你可以先查看公司的规章制度，了解其中关于调休和罚款的规定。同时，收集相关证据，如调休的原因证明、与公司的沟通记录等。然后，按照公司内部的申诉流程提出申诉。如果申诉不成功，你可以向当地的劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁。如果你还有其他疑问或需要进一步的帮助，随时都可以问我。