工伤赔偿协议低于法定标准时，该协议原则上无效，但存在部分例外情形。 具体分析如下：

1. 协议低于法定标准原则上无效
   根据《工伤保险条例》及《民法典》相关规定，工伤赔偿协议属于民事合同范畴，但其内容不得违反法律、行政法规的强制性规定。若协议约定的赔偿金额明显低于法定工伤保险待遇标准（如医疗费、伤残补助金、停工留薪期工资等），则因违反《民法典》第153条“违背公序良俗”或“强制性规定”而无效。例如，劳动者构成十级伤残，法定一次性伤残补助金为7个月本人工资，但协议仅约定支付3个月工资，此类条款通常会被认定无效。

2. 例外情形：劳动者自愿放弃部分权益且程序合法
   若协议虽低于法定标准，但满足以下条件，可能被认定有效：

   • 劳动者明确知情：用人单位需举证证明劳动者在签署协议前已充分了解法定赔偿标准（如通过书面告知、律师见证等方式），且自愿放弃部分权益；
     
   • 不存在欺诈、胁迫或显失公平：协议需是双方真实意思表示，且赔偿金额虽低于法定标准，但未达到“显失公平”程度（如劳动者仅放弃少量非核心权益，且用人单位已支付主要赔偿项目）；
     
   • 已实际履行：若协议已履行完毕，劳动者事后反悔的，法院可能结合履行情况、劳动者文化程度等因素综合判断是否支持其主张。

3. 实务建议

   • 对劳动者：签署协议前务必核对法定赔偿标准（可通过当地社保局官网或咨询律师查询），若发现协议金额过低，可拒绝签署并申请劳动仲裁；
     
   • 对用人单位：协议内容需明确列明法定赔偿项目及金额，并注明“劳动者确认已充分了解法定标准并自愿接受本协议金额”，以降低法律风险。

总结：工伤赔偿协议低于法定标准时，原则上因违法而无效，但若劳动者自愿放弃部分权益且程序合法，可能被认定有效。建议双方在签署协议前咨询专业律师，确保协议内容合法合规。若有具体案件或金额计算问题，可直接向我咨询。