有工伤赔偿协议不能直接认定工伤。工伤认定需按照法定程序进行，具体分析如下：

1. 工伤认定的法定程序：

   • 用人单位、工伤职工及其近亲属、工会组织应在事故伤害发生或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，向社保行政部门提出申请。
   • 提交的材料包括劳动合同、医疗诊断证明等。
   • 社保行政部门受理后会根据调查核实情况作出认定决定。

2. 工伤赔偿协议的性质：

   • 工伤赔偿协议是在认定工伤后，就赔偿事宜达成的协议。
   • 它本身不具备认定工伤的法律效力，只是工伤认定后处理赔偿问题的一种体现。

3. 仅有工伤赔偿协议无法完成工伤认定：

   • 工伤认定是由社会保险行政部门依据《工伤保险条例》进行的行政确认行为。
   • 需要的材料包括《工伤认定申请表》、劳动关系证明材料、医疗机构出具的受伤后诊断证明书等。
   • 工伤赔偿协议不能替代这些法定材料来证明劳动关系及受伤情况等。

因此，有工伤赔偿协议并不能直接认定工伤，仍需按照法定程序申请工伤认定。如果您在工伤认定或工伤赔偿方面有任何疑问或需要帮助，请直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议和支持。