核心结论：历史原因是协议解除劳动合同的情况下，是否还可以申请劳动仲裁，这主要取决于协议解除后是否存在未解决的劳动争议事项以及仲裁时效是否已过。以下从不同角度进行分析：

1. 仲裁时效问题：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
   • 如果协议解除劳动合同后，劳动者在一年内发现存在未解决的劳动争议事项（如工资未支付、经济补偿未达成一致等），且该事项与协议解除劳动合同直接相关，那么劳动者仍然有权申请劳动仲裁。
   • 如果超过一年仲裁时效，除非存在法定中止或中断情形，否则劳动者将丧失申请仲裁的权利。

2. 协议解除后的争议事项：

   • 协议解除劳动合同并不意味着所有劳动争议都已解决。如果协议中未明确涵盖某些事项，或者协议执行过程中出现新的问题（如用人单位未按照协议支付经济补偿、劳动者对协议中的某些条款有异议等），这些都可以成为劳动仲裁的争议事项。
   • 劳动者在申请仲裁时，需要提供充分的证据证明争议事项的存在以及自己的权益受到了侵害。

3. 具体案例分析：

   • 假设劳动者与用人单位协议解除劳动合同，并约定了经济补偿的数额和支付方式。但协议解除后，用人单位未按照约定支付经济补偿。此时，劳动者可以在一年内申请劳动仲裁，要求用人单位支付经济补偿及可能的违约金或赔偿金。
   • 另一个例子是，劳动者在协议解除劳动合同后，发现用人单位在解除前存在未支付的加班费或未缴纳的社会保险费等违法行为。这些也可以成为劳动仲裁的争议事项，但同样需要注意仲裁时效的问题。

法律建议：

• 劳动者在协议解除劳动合同后，应仔细审查协议内容，确保所有劳动争议事项都已得到妥善解决。
• 如果发现存在未解决的劳动争议事项，且仲裁时效尚未过期，应及时向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。
• 在申请仲裁前，建议劳动者收集并整理好相关证据材料，如劳动合同、协议解除证明、工资单、加班记录等，以便在仲裁过程中提供有力的支持。

可能法律后果：

• 如果劳动者在仲裁时效内申请仲裁并胜诉，用人单位可能需要支付经济补偿、加班费、社会保险费等费用，并可能面临罚款或其他行政处罚。
• 如果劳动者超过仲裁时效申请仲裁或仲裁请求被驳回，劳动者将可能失去通过法律途径解决争议的机会，需要自行承担相关损失。