签了协议后，劳动者仍然可以申请工伤赔偿（即进行工伤认定并据此主张赔偿），二者并不冲突。下面我从不同角度为你详细分析：
一、法定权利不受影响
申请工伤认定是受伤职工的法定权利，这一权利不因与用人单位签订了赔偿协议而丧失。根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在发生事故伤害或被诊断、鉴定为职业病后，有权在规定的时限内向社会保险行政部门提出工伤认定申请。因此，无论是否已签订赔偿协议，劳动者都有权依法申请工伤认定，并据此主张工伤赔偿。
二、赔偿协议的性质与影响
赔偿协议是劳动者与用人单位之间就工伤赔偿事宜达成的民事协议。它虽然对双方具有一定的约束力，但并不能替代或剥夺劳动者的工伤认定权利和工伤赔偿请求权。具体来说：
协议赔偿金额合理且自愿：
- 如果赔偿协议是在合法、自愿、公平的基础上达成的，且赔偿金额基本涵盖了工伤职工应得的赔偿项目和金额，那么即使后续进行了工伤认定，也可能不会对已签订的赔偿协议产生实质性影响。此时，劳动者可以根据工伤认定的结果，评估是否需要进一步主张权益，比如如果工伤认定等级提高，导致应得赔偿增加，劳动者可以与用人单位协商补充赔偿，或者通过法律途径主张差额部分。
协议存在欺诈、胁迫或显失公平：
- 如果赔偿协议是在用人单位欺诈、胁迫劳动者，或者协议内容显失公平的情况下签订的，那么劳动者申请工伤认定就显得尤为重要。一旦工伤认定结果确定，劳动者可以依据法定的工伤待遇标准，通过法律途径（如劳动争议仲裁、诉讼等）要求撤销或变更原赔偿协议，以确保自己的合法权益得到充分保障。例如，如果协议中约定的赔偿金额远低于法定标准，劳动者可以主张按照法定标准进行赔偿。
三、实际操作中的注意事项与建议
签订赔偿协议前：
- 劳动者应充分了解自己的权益和法定的工伤待遇标准，避免因信息不对称或缺乏专业知识而做出不利的决定。
- 建议在签订赔偿协议前咨询我，梁亭亭律师，以确保协议内容的合法性、公平性和有效性。我可以为你提供专业的法律意见，帮助你评估协议条款的合理性，并指导你如何与用人单位进行协商。
申请工伤认定时：
- 劳动者应严格按照法定程序和要求提交相关材料，如工伤认定申请表、医疗证明、事故报告等。
- 积极配合有关部门的调查和核实工作，如提供证人证言、接受现场勘查等，以确保工伤认定的顺利进行。
后续维权：
- 如果工伤认定结果与赔偿协议存在差异，或者用人单位未按照协议履行赔偿义务，劳动者可以及时通过法律途径维护自己的权益。
- 在维权过程中，劳动者应注意保留相关证据，如赔偿协议、工伤认定书、医疗费用单据等，以便在需要时提供证明。
总结来说，签了协议后劳动者仍然可以申请工伤赔偿。在处理此类问题时，应充分考虑赔偿协议的具体内容和签订情况，并根据实际情况采取相应的法律措施来维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。