结论前置：公司不配合员工进行职业病鉴定，往往出于多种考虑，但无论何种原因，这种行为都是不合法的，且会损害员工的合法权益。员工应依法采取积极措施来维护自己的权益。

一、公司不配合的可能原因

1. 经济成本考虑：职业病鉴定及后续的赔偿可能涉及较大的经济支出，公司可能出于成本控制的考虑而不愿配合。
2. 法律意识淡薄：部分公司可能对职业病防治的相关法律法规了解不足，没有意识到不配合职业病鉴定的法律后果。
3. 逃避责任：公司可能担心职业病鉴定结果会对其产生不利影响，如声誉受损、面临法律诉讼等，因此选择逃避责任。

二、员工应如何应对

1. 了解相关法律法规：

   • 员工应首先熟悉《中华人民共和国职业病防治法》等相关法律规定，明确自己在职业病诊断、鉴定过程中的权利，以及公司应承担的义务。这包括但不限于知情权、诊断权、治疗权及获得赔偿的权利等。

2. 收集相关证据：

   • 职业接触史证据：如劳动合同、工资条、工作证、考勤记录等，这些文件可以证明劳动关系及工作岗位、内容，是辅助证明工作情况及接触职业病危害因素的时长和经历的关键。
   • 职业病危害接触证据：如工作场所环境监测数据（如空气中有害物质浓度检测报告），可以向公司要求提供或请求安全生产监督管理部门检测；同事证言也是重要的证据之一。

3. 与公司沟通协商：

   • 在收集到一定证据后，员工应尝试与公司进行沟通，明确表达希望进行职业病鉴定的意愿，并要求公司提供必要的协助和支持。

4. 向相关部门投诉举报：

   • 如果公司拒绝配合，员工可以向当地安全生产监督管理部门、卫生行政部门或劳动保障监察机构投诉举报公司的违法行为。这些部门有权对公司进行调查处理，并责令其改正。

5. 自行申请职业病鉴定：

   • 在必要时，员工可以自行向有资质的职业病诊断机构申请职业病鉴定。根据《中华人民共和国职业病防治法》的相关规定，职业病诊断、鉴定过程中，在确认劳动者职业史、职业病危害接触史时，如果当事人对劳动关系、工种、工作岗位或者在岗时间有争议的，可以向当地的劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁。

6. 法律途径维权：

   • 如果投诉举报未能解决问题，员工可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，员工需提交充分证据证明公司的不配合行为及其对自身权益造成的损害。

三、法律后果

• 如果公司不配合职业病鉴定，且被证实存在违法行为，根据《中华人民共和国职业病防治法》的相关规定，公司可能会面临警告、责令限期改正、罚款等行政处罚。
• 如果因公司的不配合导致员工无法及时获得职业病诊断和治疗，公司还可能需承担民事赔偿责任，包括医疗费、误工费、残疾赔偿金等。

最后建议：面对公司不配合进行职业病鉴定的情况，员工应保持冷静，依法采取积极措施来维护自己的权益。如果你在此过程中遇到任何法律问题或困惑，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。