工厂里男员工打女老板属于违法行为，应当根据具体情况采取以下处理措施：

1. 立即制止暴力行为并确保人身安全
   无论冲突起因如何，暴力行为本身已违反《治安管理处罚法》第43条（殴打他人或故意伤害他人身体），若造成轻伤以上后果则可能触犯《刑法》第234条（故意伤害罪）。现场人员应第一时间制止暴力，优先确保女老板的人身安全，避免二次伤害。

2. 固定证据并报警处理

   • 证据收集：立即拍摄现场照片、视频，保留医疗记录、伤情鉴定报告等物证；
     
   • 证人证言：记录目击者联系方式，后续可能需配合警方调查；
     
   • 报警：由女老板或在场人员向公安机关报案，公安机关将根据伤情鉴定结果决定是否立案（轻微伤可能行政拘留，轻伤以上则刑事立案）。

3. 工厂管理方的责任与应对

   • 内部处理：工厂应依据《劳动合同法》第39条（严重违反规章制度）或内部员工手册，对涉事员工采取停职、调查、解雇等措施；
     
   • 配合调查：工厂需向警方提供监控录像、考勤记录等证据，协助还原事件经过；
     
   • 预防机制：若事件暴露工厂管理漏洞（如未及时处理员工纠纷），需完善反暴力制度并开展员工培训。

4. 女老板的维权路径

   • 民事赔偿：依据《民法典》第1179条，可要求涉事员工赔偿医疗费、误工费、精神损害抚慰金等；
     
   • 刑事追责：若构成故意伤害罪，可提起刑事附带民事诉讼，要求对方承担刑事责任及民事赔偿；
     
   • 劳动仲裁：若工厂未履行管理责任（如包庇涉事员工），可申请劳动仲裁要求工厂承担连带责任。

特殊情形提示：

• 若涉事员工存在精神疾病等特殊情况，需通过司法鉴定确认其刑事责任能力；
  
• 若冲突因工作纠纷引发（如拖欠工资、职务侵占），需同步处理劳动争议或经济纠纷，但暴力行为仍需独立追责。

建议行动步骤：

1. 优先确保人身安全并报警；
   
2. 收集证据并固定伤情；
   
3. 工厂启动内部调查程序；
   
4. 咨询律师制定民事赔偿或刑事控告方案。
   

如有进一步细节（如伤情程度、冲突背景等），可向我补充说明，我将提供更具体的法律分析。