学校考勤请假罚款一般不合法。以下从不同角度进行分析：
从教育法律法规角度
根据《中华人民共和国教育法》等相关法律法规，学校的主要职责是实施教育教学活动，对学生进行管理和教育，但并没有赋予学校对学生进行罚款的权力。罚款属于行政处罚的一种，只有具有行政处罚权的行政机关在法定职权范围内才能实施，学校作为教育机构，并非行政机关，不具备罚款的主体资格。因此，学校以考勤请假为由对学生进行罚款，缺乏法律依据，是不合法的行为。
从学生权益保护角度
学生作为受教育者，享有法律规定的各项权益，包括财产权等。学校以罚款的方式对学生的考勤请假行为进行管理，侵犯了学生的财产权。如果学校因为学生请假就对其罚款，可能会给学生造成经济负担，尤其是对于一些家庭经济困难的学生来说，这种罚款可能会带来较大的压力，不利于学生的健康成长和全面发展。
从学校管理角度
虽然学校有对学生进行考勤管理的职责，以维护正常的教学秩序，但应该采取合法、合理、适当的管理方式。罚款并不是一种有效的管理手段，它可能会引起学生的反感和抵触情绪，不利于建立良好的师生关系和校园氛围。学校可以通过加强教育引导、完善请假制度、建立激励机制等方式来引导学生遵守考勤规定，而不是简单地采取罚款措施。
建议：如果学校存在考勤请假罚款的情况，学生或家长可以向学校提出异议，要求学校停止这种违法行为，并退还已收取的罚款。如果学校不予理会，可以向当地教育行政部门投诉，由教育行政部门对学校进行监督和纠正。