工资一笔转账、一笔代发工资，在符合相关法律法规和公司规定的情况下，是合法的。以下从不同角度对此问题进行分析：
合法性分析
支付方式多样性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。支付方式并未明确限定为单一方式，因此，用人单位采用转账和代发工资相结合的方式支付工资，并不违反法律规定。
代发工资的合法性：
- 代发工资是用人单位与银行或其他金融机构签订协议，由金融机构代为发放工资的一种方式。这种方式在现实中被广泛采用，因为它可以提高工资发放的效率和准确性，减少用人单位的财务负担。只要代发工资的过程符合相关法律法规和协议约定，就是合法的。
转账的合法性：
- 转账是另一种常见的工资支付方式。用人单位通过银行转账将工资直接打入劳动者的银行账户，既方便又安全。这种方式同样符合《中华人民共和国劳动法》及相关规定中关于工资支付的要求。
注意事项
确保工资足额支付：
- 无论采用何种支付方式，用人单位都必须确保工资足额支付给劳动者。不得克扣或无故拖欠劳动者的工资。
遵守税收规定：
- 用人单位在支付工资时，必须遵守国家税收规定，依法代扣代缴个人所得税。转账和代发工资过程中，应确保税收的准确计算和及时缴纳。
保留支付记录：
- 用人单位应妥善保留工资支付记录，包括转账凭证和代发工资的明细等。这些记录是证明用人单位已按时足额支付工资的重要依据，也是处理劳动争议时的重要证据。
遵守公司规定和劳动合同：
- 除了遵守法律法规外，用人单位还应遵守公司内部规定和与劳动者签订的劳动合同中关于工资支付方式的约定。如果劳动合同或公司规定中明确规定了工资支付方式，用人单位应按照约定执行。
可能的法律后果
如果用人单位在工资支付过程中存在违法行为，如克扣或无故拖欠工资、未依法代扣代缴个人所得税等，将可能面临以下法律后果：
- 劳动行政部门处罚：劳动行政部门有权对用人单位的违法行为进行处罚，包括责令改正、罚款等。
- 劳动者索赔：劳动者有权向用人单位索赔因违法行为造成的损失，包括工资差额、经济补偿等。
- 法律诉讼：在严重情况下，劳动者可能通过法律途径维护自己的权益，提起劳动争议仲裁或诉讼。
建议：用人单位在采用转账和代发工资相结合的方式支付工资时，应确保符合相关法律法规和公司规定的要求，避免违法行为的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。