结论：在被扣工资的情况下停掉工厂生产线的电源被罚款，该罚款是否具有法律效应，需根据具体情况判断，若工厂有合法有效的规章制度且该行为违反了规章制度，则罚款可能具有法律效应；若工厂规章制度不合法或该行为未违反规章制度，则罚款可能不具有法律效应。以下从不同角度进行分析：
工厂规章制度合法性角度
规章制度合法且明确规定：
- 如果工厂有合法有效的规章制度，且该规章制度明确规定了员工在何种情况下会受到罚款处罚，包括但不限于停掉生产线电源等破坏生产秩序的行为，那么工厂依据该规章制度对员工进行罚款，是具有法律效应的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
规章制度不合法或未明确规定：
- 如果工厂的规章制度不合法，例如未经民主程序制定、未公示或告知劳动者等，或者规章制度中未明确规定停掉生产线电源会受到罚款处罚，那么工厂对员工进行罚款就缺乏法律依据，该罚款可能不具有法律效应。
员工行为性质角度
员工行为构成违纪：
- 如果员工停掉工厂生产线的电源，确实构成了违反工厂规章制度或劳动纪律的行为，且该行为给工厂造成了损失或影响了生产秩序，那么工厂依据合法有效的规章制度对员工进行罚款，是合理的。
员工行为不构成违纪或存在合理理由：
- 如果员工停掉电源的行为并非出于故意或恶意，而是由于疏忽、误操作或存在其他合理理由（如紧急避险等），且该行为未给工厂造成实际损失或影响较小，那么工厂对员工进行罚款可能缺乏合理性，该罚款可能不具有法律效应。
罚款合法性及限度角度
- 罚款合法性：即使工厂有合法有效的规章制度，且员工行为构成了违纪，但罚款本身也需符合法律法规的规定。例如，罚款的数额不得超过法律法规规定的限度，否则该罚款可能因违法而无效。
- 罚款限度：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
建议：
- 对于员工而言，如果认为工厂的罚款不合理或违法，可以与工厂进行协商，要求撤销或调整罚款。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 对于工厂而言，在制定和执行规章制度时，应确保规章制度的合法性和合理性，明确罚款的条件和限度，避免因罚款问题引发劳动争议。
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