结论概述：
只有合同没有确权证的土地被政府违法划入后备耕地审批后，对承包经营权益人的影响是多方面的，既存在不利影响，也可能带来一定的“积极”变化（此处积极变化需结合实际情况判断，且通常非直接利益，而是可能伴随的补偿或调整机会），但核心在于政府行为的违法性对权益人权益的侵害及后续处理。
不利影响分析：
权益受损：
- 承包经营权益人基于合同享有的土地使用权受到侵害。由于土地被违法划入后备耕地，权益人可能面临无法继续按照原合同使用土地的风险，导致其承包经营权益受损。
- 若土地是权益人的主要生产资料，这种侵害可能直接影响其生计和收入来源。
法律风险增加：
- 政府违法划地行为可能引发一系列法律纠纷，包括行政诉讼、民事赔偿等。权益人需要投入时间和精力去应对这些纠纷，增加了其法律风险和经济负担。
- 在纠纷解决过程中，权益人可能面临举证困难、诉讼周期长等问题，进一步加剧了其不利地位。
补偿不确定性：
- 尽管政府违法划地后可能需要对权益人进行补偿，但补偿的标准、方式和时间等往往存在不确定性。权益人可能面临补偿不足或无法及时获得补偿的风险。
可能带来的变化及应对建议：
关注政府后续行为及补偿方案：
- 权益人应密切关注政府后续的行为动态，包括是否启动补偿程序、补偿方案的具体内容等。
- 若政府提出补偿方案，权益人应仔细审查方案内容，确保其合法权益得到充分保障。如认为补偿不足或不合理，可及时提出异议并寻求法律援助。
考虑法律途径维护权益：
- 针对政府违法划地行为，权益人可以考虑通过行政诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
- 在提起诉讼前，权益人应收集充分证据，包括合同、土地使用证明、政府划地文件等，以证明自己的权益受到侵害。
- 权益人还可以咨询专业律师，了解诉讼流程和注意事项，提高诉讼成功率。
探索土地调整或置换可能性：
- 在某些情况下，政府可能为了公共利益的需要而调整土地用途或进行土地置换。权益人可以与政府协商，探索这种可能性，以尽量减少自己的损失。
- 如达成土地调整或置换协议，权益人应确保协议内容明确、合法，并办理相关手续，以保障自己的权益。
法律背景与依据：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规，政府在划定后备耕地时，应遵循法定程序，确保不侵害承包经营权益人的合法权益。
- 若政府违法划地，权益人有权依法要求政府承担相应的法律责任，包括停止侵害、恢复原状、赔偿损失等。
后续行动建议：
- 权益人应尽快咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的维权途径。
- 同时，权益人应保持冷静，避免采取过激行为，以免加剧矛盾或损害自己的合法权益。
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