宅基地停工通知书的合法性需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法情形
符合法定程序：
- 如果相关部门（如自然资源部门、乡镇政府等）在发出停工通知书前，已经进行了充分的调查取证，确认您的宅基地建设行为违反了相关法律法规（如未经批准擅自建设、超出批准范围建设等），并且按照法定程序（如书面通知、听证等）进行了告知和听证，那么这样的停工通知书是合法的。
基于公共利益需要：
- 在某些特殊情况下，如宅基地建设可能危及公共安全、影响城市规划或环境保护等，相关部门为了维护公共利益，可以依法发出停工通知书。这种情况下，停工通知书也是合法的。
二、不合法情形
无合法依据：
- 如果相关部门没有充分的证据证明您的宅基地建设行为违法，或者没有明确的法律法规作为依据，就随意发出停工通知书，那么这样的停工通知书是不合法的。
程序违法：
- 如果相关部门在发出停工通知书时，没有遵循法定程序，如未进行调查取证、未告知听证权利、未出具书面通知等，那么这样的停工通知书也是不合法的。
超越职权范围：
- 如果发出停工通知书的部门超越了其法定职权范围，如乡镇政府未经授权就发出涉及城市规划的停工通知书，那么这样的停工通知书同样是不合法的。
三、应对建议
核实停工通知书的合法性：
- 当您收到宅基地停工通知书时，首先要仔细阅读通知书内容，了解发出通知书的部门、依据的法律法规以及具体的停工原因。
- 然后，您可以向相关部门咨询或要求其提供充分的证据和法律依据，以核实停工通知书的合法性。
依法维权：
- 如果您认为停工通知书不合法，或者对停工原因有异议，您可以依法向相关部门提出申诉或行政复议。
- 在申诉或行政复议过程中，您可以提供相关证据和法律依据来支持自己的观点，并要求相关部门撤销不合法的停工通知书。
寻求法律帮助：
- 如果您在处理宅基地停工通知书问题时遇到困难或疑问，可以向我咨询。我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
总结来说，宅基地停工通知书的合法性取决于多个因素，包括发出通知书的部门、依据的法律法规、具体的停工原因以及是否遵循法定程序等。如果您对停工通知书的合法性有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。