结论：自离三个月后，是否还存在劳动合同关系，不能一概而论，需根据具体情况判断。

分析说明：

1. 自动离职与劳动合同解除的关系：

   • 自动离职，通常指的是员工在未与公司协商一致，也未按照法定程序提前通知的情况下，擅自离开工作岗位的行为。
   • 劳动合同的解除，需要符合法定条件或双方协商一致。自动离职本身并不直接导致劳动合同的解除，除非公司随后采取了相应的解除劳动合同的措施，如发出解除劳动合同通知书等。

2. 自离三个月后劳动合同关系的状态：

   • 若公司未采取解除措施：如果员工自动离职后，公司没有发出解除劳动合同的通知，也没有通过其他方式表明与员工解除劳动合同的意愿，那么劳动合同关系可能仍然存在。但这种情况下，员工可能因擅自离职而承担违约责任或面临其他法律后果。
   • 若公司已采取解除措施：如果员工自动离职后，公司及时发出了解除劳动合同的通知，并符合法定解除条件（如员工严重违反公司规章制度等），那么劳动合同关系自通知到达员工时起解除。此时，自离三个月后，劳动合同关系已经不存在。
   • 特殊情况：如果员工自动离职后，公司既未采取解除措施，也未支付工资或提供劳动条件，员工可能有权依据相关法律法规主张公司违法解除劳动合同或要求支付工资等。但这种情况下，劳动合同关系的状态可能因具体案件事实和法律规定而有所不同。

3. 法律建议：

   • 对于员工而言，如果自动离职后希望确认劳动合同关系是否仍然存在，建议及时与公司沟通并了解公司的态度。如果公司未采取解除措施，员工应考虑是否愿意继续履行劳动合同或承担违约责任。
   • 对于公司而言，如果员工自动离职，公司应及时发出解除劳动合同的通知（如果符合法定解除条件）或采取其他措施以明确劳动合同关系的状态。同时，公司应保留好相关证据，以备不时之需。

后续行动建议：

• 如果你作为员工，对自离后劳动合同关系的状态存在疑问，建议直接与公司沟通并了解具体情况。如果公司未给出明确答复或你与公司之间存在争议，可以向我咨询具体的法律意见和解决方案。
• 如果你作为公司方，面对员工自动离职的情况，建议及时咨询专业律师，了解法定解除条件和相关程序，以确保公司行为的合法性和有效性。

特殊场景提醒：

• 在某些特殊情况下，如员工因病或非因工负伤无法继续工作而自动离职，或公司存在违法行为导致员工被迫离职等，劳动合同关系的解除可能受到不同法律法规的调整。此时，建议根据具体情况咨询专业律师以获取准确的法律意见。