在关联公司拆迁中，设备搬迁费的承担主体及计算方式需根据具体情况来确定，以下分情况讨论：
合同有约定的情况：
- 承担主体：如果关联公司之间或关联公司与拆迁方之间的合同中明确约定了设备搬迁费的承担主体，那么应按照合同约定来执行。这是基于合同自由原则，即合同双方有权在合同中约定各自的权利和义务。
- 计算方式：合同中可能也会约定设备搬迁费的具体计算方式，如按照设备数量、重量、搬迁距离或搬迁难度等因素进行计算。若合同有明确约定，则直接按照合同约定执行。
合同无约定或约定不明的情况：
- 承担主体：在合同无约定或约定不明的情况下，设备搬迁费的承担主体可能需要根据拆迁的实际情况、关联公司之间的合作关系以及公平原则等因素来综合判断。一般来说，如果拆迁是由于政府行为或公共利益需要而进行的，且关联公司之间没有明确的责任划分，那么设备搬迁费可能由关联公司共同承担或根据各自受益情况按比例承担。如果拆迁是由于某一关联公司的特定行为（如扩建、改造等）而引发的，那么该关联公司可能应承担主要的设备搬迁费用。
- 计算方式：在合同无约定或约定不明的情况下，设备搬迁费的计算方式可能需要根据实际情况进行协商确定。可以参考市场行情、搬迁难度、设备价值等因素来制定一个合理的计算标准。如果协商不成，也可以寻求第三方评估机构的帮助来确定搬迁费用。
法律规定的特殊情况：
- 承担主体与计算方式：在某些特殊情况下，法律可能对设备搬迁费的承担主体和计算方式有明确规定。例如，如果拆迁涉及到国有土地上房屋征收与补偿，那么根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》的相关规定，因征收房屋造成搬迁的，房屋征收部门应当向被征收人支付搬迁费。在这种情况下，设备搬迁费可能作为搬迁费的一部分由房屋征收部门承担。具体计算方式可能需要根据当地政府制定的补偿标准来确定。
在处理关联公司拆迁设备搬迁费问题时，建议采取以下步骤：
- 审查合同：首先审查关联公司之间或关联公司与拆迁方之间的合同，查看是否有关于设备搬迁费的明确约定。
- 协商确定：如果合同无约定或约定不明，建议关联公司之间进行协商，根据实际情况和公平原则来确定设备搬迁费的承担主体和计算方式。
- 寻求法律帮助：如果协商不成或存在争议，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径来解决纠纷。
举例说明：假设有两家关联公司A和B，共同使用一块土地上的房屋进行生产经营。现在政府因公共利益需要对该土地进行征收，并要求A和B搬迁。如果A和B之间的合同中没有约定设备搬迁费的承担主体和计算方式，那么A和B可以根据各自在搬迁过程中的受益情况、设备价值、搬迁难度等因素进行协商，共同承担设备搬迁费用，并协商确定一个合理的计算方式。如果协商不成，可以寻求第三方评估机构的帮助或通过法律途径来解决纠纷。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。