结论是：在矿山工作三个月后查出尘肺，公司是否负责需视具体情况而定，但通常情况下，若尘肺被认定为职业病且与公司工作相关，公司应承担相应责任。以下从多个角度进行分析：
一、尘肺与职业病的关系
尘肺是一种由于长期吸入生产性粉尘（灰尘）并在肺内潴留而引起的以肺组织弥漫性纤维化（疤痕）为主的疾病。根据《中华人民共和国职业病防治法》的规定，尘肺属于法定职业病之一。这意味着，如果劳动者在工作过程中因接触粉尘而患上尘肺，且该疾病被认定为职业病，那么劳动者有权享受相应的职业病待遇。
二、公司责任的前提条件
尘肺被认定为职业病：
- 劳动者需要到具有职业病诊断资质的医疗机构进行诊断，并取得职业病诊断证明书。
- 诊断过程中，医疗机构会考虑劳动者的职业史、职业病危害接触史和工作场所职业病危害因素情况等因素。
尘肺与公司工作相关：
- 劳动者需要证明其尘肺是在公司工作期间因接触粉尘而患上的。
- 这通常需要通过职业病诊断证明书、工作记录、证人证言等证据来支持。
三、公司可能承担的责任
工伤认定与赔偿：
- 如果尘肺被认定为职业病，且与公司工作相关，那么劳动者可以向当地社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 一旦被认定为工伤，劳动者有权享受工伤保险待遇，包括医疗费、康复费、护理费、一次性伤残补助金等。
- 如果公司未为劳动者缴纳工伤保险费，那么这些费用将由公司承担。
民事赔偿责任：
- 除了工伤保险待遇外，如果公司存在过错（如未提供必要的劳动保护用品、未进行职业病危害告知等），劳动者还可以要求公司承担民事赔偿责任。
- 民事赔偿的范围可能包括精神损害抚慰金、后续治疗费等。
四、特殊情况与注意事项
劳动关系确认：
- 在某些情况下，劳动者与公司之间的劳动关系可能存在争议。这时，劳动者需要先通过劳动仲裁或诉讼确认劳动关系，然后再进行工伤认定和赔偿申请。
职业病诊断与鉴定：
- 职业病诊断是一个复杂的过程，可能涉及多个医疗机构和专家。劳动者需要积极配合诊断工作，并提供必要的证据和资料。
- 如果对职业病诊断有异议，劳动者可以向当地卫生行政部门申请鉴定。
时效问题：
- 劳动者需要注意工伤认定和赔偿申请的时效问题。一般来说，工伤认定申请需要在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起一定期限内提出（具体期限根据当地规定而定）。
建议：如果您在矿山工作三个月后查出尘肺，并怀疑这与公司工作相关，建议您尽快到具有职业病诊断资质的医疗机构进行诊断，并收集相关证据（如工作记录、证人证言等）。同时，您可以向当地社会保险行政部门咨询工伤认定和赔偿的具体流程和要求。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。