关于建筑单位三级公司总经理的亲属是否可以担任项目经理的问题，这主要涉及到建筑施工企业的三类人员管理规定以及相关的回避制度或利益冲突原则。

首先，我们需要明确建筑施工企业的三类人员定义：

1. 企业主要负责人（A类）：通常指的是对本企业生产经营活动和安全生产工作具有决策权的领导人员，如企业法人代表、总经理等。

2. 项目负责人（B类）：这是指取得相应注册执业资格，并由企业法定代表人授权，负责具体工程项目管理的人员。项目经理通常就属于这一类别。

3. 专职安全生产管理人员（C类）：这类人员在企业中专职从事安全生产管理工作。

接下来，针对您的问题进行具体分析：

• 亲属关系与职位任命：在一般的商业实践中，亲属关系本身并不直接构成担任某一职位的障碍。然而，在建筑施工企业，特别是涉及到工程项目管理的关键职位如项目经理时，企业可能会考虑避免潜在的利益冲突或管理上的不便。这通常取决于企业的内部管理制度、回避政策以及相关法律法规的要求。

• 资质与授权：担任项目经理需要取得相应的注册执业资格，并由企业法定代表人授权。这意味着，即使总经理的亲属符合其他条件，也必须满足这些基本的资质和授权要求。

• 利益冲突与回避：如果总经理的亲属担任项目经理，可能会引发关于利益冲突、公正管理和决策透明度的担忧。因此，一些企业可能会制定内部政策，要求在这种情况下进行回避或采取其他措施来确保管理的公正性和透明度。

综合建议：

1. 查阅企业内部政策：首先，应查阅建筑单位三级公司的内部管理制度和回避政策，了解是否有关于亲属担任关键职位的具体规定。

2. 咨询专业法律意见：如果内部政策不明确或存在争议，建议咨询专业的法律顾问或律师，以了解相关法律法规的要求和潜在的法律风险。

3. 考虑企业形象与公正性：即使法律和内部政策没有明确禁止，也应考虑此举可能对企业形象和公正性产生的影响，以及是否可能引发员工或合作伙伴的质疑。

总之，建筑单位三级公司总经理的亲属在符合资质和授权要求的前提下，理论上可以担任项目经理。但具体是否可行还需考虑企业的内部政策、利益冲突原则以及相关法律法规的要求。因此，在做出决定前，建议进行充分的咨询和评估。