结论：事假一天扣三天工资的做法，一般是不合理的，但具体是否合理还需结合公司规章制度、劳动合同以及相关法律法规来综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、法律法规角度
工资支付规定：
- 根据《工资支付暂行规定》及各地相关实施细则，员工因事假未提供劳动期间，用人单位可以不支付工资。但并未规定可以扣除超过事假天数的工资。
- 工资是员工提供劳动后应得的报酬，扣除工资应当与未提供劳动的天数相对应，超出部分缺乏法律依据。
规章制度合法性：
- 如果公司规章制度中明确规定了事假扣除工资的规则，且该规则不违反法律法规的强制性规定，那么该规则在一定程度上是有效的。
- 但规章制度必须经过民主程序制定，并向员工公示或告知，否则可能因程序违法而被认定无效。
二、实际操作角度
公司自主权：
- 公司有权根据自身经营情况和员工管理需要制定规章制度，包括事假扣除工资的规则。
- 但这种自主权并非无限，必须受到法律法规的约束，不能侵犯员工的合法权益。
员工权益保护：
- 员工有权要求公司按照法律法规和劳动合同的约定支付工资。
- 如果公司扣除工资的行为违反了法律法规或劳动合同的约定，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
三、具体案例分析
- 假设案例：某员工因个人原因请事假一天，公司按照规章制度扣除其三天工资。
- 分析：如果公司规章制度中明确规定了事假扣除三天工资的规则，但该规则未经过民主程序制定或未向员工公示，或者该规则违反了法律法规的强制性规定（如最低工资标准等），那么该规则可能无效，员工有权要求公司补发被扣除的工资。
四、建议与措施
对公司：
- 制定规章制度时，应确保内容合法合规，经过民主程序制定，并向员工公示或告知。
- 在扣除员工工资时，应确保扣除的金额与未提供劳动的天数相对应，避免侵犯员工的合法权益。
对员工：
- 在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，了解公司关于事假扣除工资的规定。
- 如果公司扣除工资的行为违反了法律法规或劳动合同的约定，应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
总结：事假一天扣三天工资的做法一般是不合理的，但具体是否合理还需结合公司规章制度、劳动合同以及相关法律法规来综合判断。如果公司扣除工资的行为违反了法律法规或劳动合同的约定，员工有权要求公司补发被扣除的工资或采取其他法律措施维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。