公司分两个工资账户发放工资，这一行为本身并不直接违法，但关键在于是否满足相关法律法规的要求，特别是关于工资支付、税务申报以及社保缴纳等方面的规定。以下从不同角度为你详细分析：
合法性角度
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按时足额支付劳动者工资，且工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。这里并未明确规定工资必须通过单一账户支付，因此，从形式上看，分两个账户发放工资并不直接违反法律。
税务申报与缴纳：
- 关键在于公司是否按照税法规定，对通过两个账户发放的工资总额进行了正确的税务申报和缴纳。如果公司能够确保所有工资收入都依法纳税，那么分账户发放并不构成违法。
- 若存在避税或逃税行为：例如，通过一个账户发放部分工资以规避个人所得税，而另一个账户则用于发放未申报的工资或奖金，这种行为就是违法的，可能面临税务处罚。
社保缴纳：
- 公司应按照劳动者实际工资总额缴纳社会保险费。如果分账户发放工资导致社保缴纳基数不实，即未按照劳动者实际工资总额缴纳社保，那么这种行为也是违法的，可能面临社保部门的处罚。
实际操作与风险角度
操作合规性：
- 公司应确保分账户发放工资的操作合规，包括但不限于：与劳动者签订明确的工资支付协议、保留完整的工资支付记录、确保税务和社保申报的准确性等。
劳动者权益保护：
- 劳动者有权了解自己的工资构成和支付方式。如果公司分账户发放工资但未充分告知劳动者，或者存在隐瞒、欺诈等行为，那么劳动者的权益可能受到侵害。
- 劳动者在发现公司存在违法支付工资的行为时，有权向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
公司风险：
- 分账户发放工资可能增加公司的管理成本和风险。例如，如果公司未能妥善管理两个账户，可能导致工资支付混乱、税务申报错误等问题，进而引发法律纠纷和财务损失。
建议与措施
公司应确保合规操作：
- 如果公司确实需要分账户发放工资，应确保操作合规，包括与劳动者签订明确的协议、保留完整的记录、确保税务和社保申报的准确性等。
劳动者应了解自己的权益：
- 劳动者有权了解自己的工资构成和支付方式，并有权要求公司提供详细的工资支付记录。如果发现公司存在违法支付工资的行为，应及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
加强沟通与透明度：
- 公司应加强与劳动者的沟通，确保劳动者了解分账户发放工资的原因和操作方式，以增强透明度和信任度。
总结来说，公司分两个工资账户发放工资并不直接违法，但必须确保操作合规、税务申报准确、社保缴纳真实，并充分保障劳动者的权益。如果有任何疑问或发现公司存在违法支付工资的行为，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。