员工上年度入职仅3个月的情况下，计算平均工资需根据具体用途确定计算方式，常见情形如下：

1. 计算经济补偿金/赔偿金时
   根据《劳动合同法实施条例》第二十七条，经济补偿的月工资按劳动者应得工资计算，包括计时工资、计金、奖金、津贴等货币性收入。若劳动者工作不满12个月，按实际工作月数计算平均工资。例如：员工3个月工资分别为8000元、8500元、9000元，则平均工资为（8000+8500+9000）÷3=8500元。

2. 计算加班费、未休年休假工资时
   若需折算日工资或小时工资，通常按实际工作月数的平均工资作为基数。例如：计算未休年休假工资时，日工资=平均工资÷21.75天（月计薪天数）。

3. 特殊情形：社保/公积金缴费基数
   部分地区规定，新入职员工社保缴费基数可按首月工资确定，或按实际工作月数的平均工资申报（具体以当地政策为准）。例如：某地规定新员工社保基数按首月工资，则无需计算3个月平均工资。

注意事项：

• 计算时需包含所有货币性收入（如奖金、补贴），但排除非经常性收入（如一次性补偿）；
  
• 若涉及经济补偿，需按税前工资计算；
  
• 各地对平均工资计算可能有细化规定（如北京、上海对经济补偿基数有上限），建议结合当地政策操作。
  

如有具体计算场景或地区差异问题，可进一步说明细节，我会为您详细解答。