开发商股东向施工单位拿回扣的行为涉嫌违法，可能涉及商业贿赂和不正当竞争，需根据具体情况采取法律措施处理。以下从不同角度展开分析：

1. 法律定性角度
   根据《刑法》第164条，公司、企业或其他单位工作人员利用职务便利，索取或非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额较大的，构成非国家工作人员受贿罪；若股东为国家工作人员（如国企背景），则可能触犯《刑法》第385条受贿罪。施工单位主动给予回扣的，可能构成《刑法》第164条对非国家工作人员行贿罪，或第389条行贿罪。此外，《反不正当竞争法》第7条明确禁止经营者采用财物或其他手段贿赂交易相对方的工作人员，此类行为可能面临行政处罚（如罚款、没收违法所得）。

2. 处理措施角度

   • 内部处理：开发商应立即启动内部调查，固定证据（如转账记录、聊天记录、证人证言），依据公司章程或劳动合同对涉事股东进行处分（如罢免职务、追偿损失），并完善内部合规制度（如建立反贿赂条款、加强财务审计）。
     
   • 刑事报案：若回扣金额达到刑事立案标准（如非国家工作人员受贿罪6万元以上），开发商可向公安机关经侦部门报案，由司法机关介入侦查。
     
   • 民事追责：开发商可依据《民法典》第154条主张回扣行为因恶意串通损害公司利益而无效，要求施工单位返还已支付的回扣，并赔偿因行贿导致的损失（如工程质量问题、工期延误等）。
     
   • 行政举报：向市场监管部门举报施工单位的不正当竞争行为，由其依法处罚（如罚款、列入严重违法失信名单）。

3. 风险防范角度

   • 合同条款：在施工合同中明确约定反贿赂条款，约定违约责任（如违约金、解除合同），并要求施工单位签署《廉洁承诺书》。
     
   • 资金监管：建立工程款支付审批流程，要求施工单位提供合法发票，避免现金交易，对大额支出进行背景调查。
     
   • 合规培训：定期对股东、高管及关键岗位人员进行反商业贿赂培训，强化法律意识。

建议：若您是开发商或相关方，需立即委托律师介入，评估证据充分性、金额标准及法律风险，制定综合处理方案（如刑事报案与民事索赔同步推进）。如有进一步细节（如回扣方式、金额、是否已暴露等），可向我补充说明，以便提供更精准的建议。